Análisis de imagen con herramientas libres FIJI (is just image J)
http://fiji.sc/Fiji Como dicen en su página Web el Fiji es al Image J como el Ubuntu es al Linux.
Requisitos instalación
Ejecutar FIJI Fiji-win64 Fiji.app ImageJ-win64
EJERCICIO 1
- Imagen digital Píxel - Píxel Es la unidad menor de la que se compone una imagen.
Segmentación Selección de objetos, áreas o características de interés dentro de una imagen(foreground) y no selección del resto de imagen(background).
- Imagen digital Modelos de color - Modelo RGB HSI CMYK Cada color se expresa como la cantidad de luz Roja (R), Verde (G), y azul (B) que contiene cada píxel. - Modelo RGB
16.777.216 255 R G B R G B 0 0 0 R G B 166 166 166 R G B 118 62 69 R G B 255 255 255
Calibración de imágenes
Selección de áreas teñidas de forma positiva.
EJERCICIO 2
Es un programa sencillo que automatiza una serie de comandos del FIJI Es un programa sencillo que automatiza una serie de comandos del FIJI. La manera más fácil de crear una macro es grabando una secuencia de comandos utilizando el Macro Recorder Macro
( ) - = + Brown Channel = B- (R +G)*0.3 X 0.3 Ruifrok, A.C.: Quantification of immunohistochemical staining by color translation and automated thresholding. Anal Quant Cytol Histol. 19, 107-113 (1997). Brown Channel = B- (R +G)*0.3 Brown B R G - + ( ) X 0.3 =
Imagen 1.jpg(blue) Imagen Result
Cierra de imágenes innecesarias
MUCHAS GRACIAS