Cartografía del genoma en eucariotas. I. Mapas genéticos Tema 10 Cartografía del genoma en eucariotas. I. Mapas genéticos 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.- Cruzamiento de tres puntos 5.- Interferencia y coincidencia 6.- Relación entre distancia genética y frecuencia de recombinación * Unidad de mapa * Función de mapa

CARTOGRAFÍA DEL GENOMA EN EUCARIOTAS I.- MAPA GENÉTICO TEMA 10 Localización de genes basada en frecuencia de recombinación II.- MAPA FÍSICO TEMA 11 Localización de genes basada en: - Hibridación somática interespecífica - FISH - Secuenciación....

"The linear order of the genes implies distance between them, for which the crossover values stand as indices. It is obvious that if the order of the genes remained the same but something doubled the number of crossovers between two loci, their 'distance' apart would at thesame time appear to have doubled… " - Thomas Hunt Morgan, The Physical Basis of Heredity, 1919 (concluding remarks from the chapter entitled "The Order of the Genes".)

A principios de siglo... “ Cuanto mayor es la distancia entre genes ligados, mayor es la probabilidad de que ocurra un entrecruzamiento entre cromátidas no hermanas en la zona de separación de estos genes y por tanto mayor será el número de descendientes recombinantes “ % de recombinación medida de la distancia genética INDIVIDUO AaBb - Si A y B son independientes aB Ab - Si A y B están ligados (en acoplamiento) 50% < 50% (Frecuencia de recombinación < 0.5)

CALCULO FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN

CRUZAMIENTO DE TRES PUNTOS - Estudiar el ligamiento entre tres loci 1.- Orden 2.- Distancia genética (frec. Recomb.) TRES GENES Color del cuerpo b+, b Color de los ojos p+, p Morfología del ala c+, c Tres notaciones distintas - bbppcc b/b p/p c/c bpc/bpc b+b+p+p+c+c+ x bbppcc bbppcc 5617 bbppc+c 1383 bbp+pcc 72 bbp+pc+c 367 b+bppcc 388 b+bppc+c 60 b+bp+pcc 1412 b+bp+pc+c 5701 / TOTAL 15000 b+bp+pc+c x bbppcc

X MAPA GENÉTICO DE TRES LOCI 1º. El gen que está en el centro se puede determinar mirando los dobles recombinantes. b p c X X bbp+pcc b+bppc +c 2Q b + p + c + 2º. La distancia más grande determina los loci de los extremos. 3º. bpc o cpb 4º. La distancia entre los loci dos a dos es > que la calculada entre los loci de los extremos “Las distancias de mapa mas exactas son las que se establecen entre loci ligados muy próximos”

COEFICIENTE DE COINCIDENCIA Nº de dobles recombinantes observado Nº de dobles recombinantes esperado - Si es < que 1 quiere decir que la presencia de determinados quiasmas influye para que no se produzca otro en un lugar próximo COEFICIENTE DE INTERFERENCIA Expresa la reducción del número de dobles quiasmas observados, en relación a los esperados ( 1 - coeficiente de coincidencia)

1 UNIDAD DE MAPA = 1cM = F.R. de 0.01 (1%) MAPA DE LIGAMIENTO ó MAPA GENÉTICO Frecuencia de recombinación Distancia genética 1 UNIDAD DE MAPA = 1cM = F.R. de 0.01 (1%) Unidad de mapa unidad de medida de mapa genético Def. Distancia entre dos genes para la que uno de cada 100 productos de la meiosis resulta ser recombinante Función de mapa Def. Función matemática que relaciona la frecuencia de recombinación y la distancia genética

FUNCIONES DE MAPA