Frameshifting.

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Transcripción de la presentación:

Frameshifting

CONTENIDO Definicion Terminos relacionados estimuladores del frameshifting CONTENIDO

Definición

Frameshifting: Cambio en el marco de lectura en un sitio del mRNA ridiendo en una proteina codificada por 2 ORFs solapantes

EL MOVIMIENTO EN EL CUADRO DE LECTRURA SERA DE UNA BASE EN SENTIDO 3´O 5´ (frameshifting + / – 1)

El frameshifting es parte del Recoding: Procesos de desviación de las reglas estándar de codificación (son requeridos por algunos organismos procaritas y eucariotas en condiciones determinadas)

Descrito principalmente en Virus Retrotransposones Elementos de inserción bacterianos También en genes celulares

ESTIMULADORES DEL FRAMESHIFTING

RIO ARRIBA DEL SITIO DE FRAMESHIFTING SECUENCIAS TIPO SHINE-DALGARNO RIO ARRIBA DEL SITIO DE FRAMESHIFTING

Estructuras 2ª : pseudoknots

Han de solapar con el sitio de frameshifting Codones de STOP CONDICION: Han de solapar con el sitio de frameshifting UAG UGA UAA CUU UGA DESPLAZAMIENTO +1

( E.coli; CGA codon raro para Arg) Secuencias nucleotidicas UUUPy GGGG… o UUUU… STOP CCC CGA ( E.coli; CGA codon raro para Arg)

Bajos niveles de aa-tRNA Sitio A vacio mas tiempo Estimula frameshifting

Capacidad del tRNA para interaccionar con el codon cambiado en el sitio P

Otros términos relacionados

Alteracion en la codificación: recoding Al final de la traducciónreadthrough Durante la elongacion  frameshifting y hopping

READTHROUGH EJEMPLO: INSERCION DE Sec Requiere elementos especiales

HOPPING Suspension y salto en la traduccion

tmRNA: Mensajero y transferente Control de calidad ante mensajeros truncados (bacterias)

FIN

BIBLIOGRAFIA SUPER COMPLETO¡¡¡¡¡¡¡¡ Pavel V. Baranov, Olga L. Gurvich, Andrew W. Hammer, Raymond F. Gesteland and John F. Atkins. RECODE 2003. Nucleic Acids Research, 2003, Vol. 31, No. 1 Ping Shu, Huacheng Dai1, Wlodek Mandecki2, Emanuel Goldman CCC CGA is a weak translational recoding site in Escherichia coli. Gene 343 (2004) 127–132 Beatrice Cobucci-Ponzano, Mosè Rossi andMarco Moracci. Recoding in Archaea. Molecular Microbiology (2005) 55 (2), 339–348