Dos tipos de reacciones de sellado de muescas de DNA

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Transcripción de la presentación:

Dos tipos de reacciones de sellado de muescas de DNA Dos tipos de reacciones de sellado de muescas de DNA. Se representan dos formas de sellado de muesca; estos procesos proceden en cuatro pasos (i) → (iv). Las enzimas involucradas se denotan por E (arriba, abajo), mientras que los reactivos y productos de molécula pequeña se indican como fosfato (P); pirofosfato (PP), fosfato inorgánico (Pi; generado a partir de PP por la acción de pirofosfatasas omnipresentes), ribosa (R) y adenina (A). La reacción de sellado de muesca en la parte superior es catalizada por DNA a topoisomerasa I, y es independiente de energía de ATP porque la energía para la reformación de enlaces fosfodiéster de DNA es almacenada dentro de la unión covalente de topoisomerasa a DNA (-P-E; arriba) como se muestra por el ataque nucleofílico del grupo OH 3′ (flecha verde, paso iii) al fosfato del complejo P-E. La reacción de sellado de muesca catalizada por DNA ligasa (abajo) repara roturas en el esqueleto fosfodiéster de DNA que se producen por replicación del DNA y/o reparación del DNA. La reacción de DNA ligasa completa requiere hidrólisis de dos de los enlaces fosfodiéster de alta energía del ATP. Se describe el esquema de la reacción general de la DNA ligasa desde enzima libre, pasando por activación de enzima que libera pirofosfato (PP), hasta la liberación de enzima libre y liberación de AMP (abajo; como se mencionó, el PP es convertido con rapidez en 2 moles de Pi por la acción de pirofosfatasas omnipresentes). La ligasa activada (E-P-R-A) reacciona con el P 5′ en el sitio de la muesca para formar un complejo de DNA-P-P-R-A(P-R-A=AMP) transitorio que libera la enzima, E. El ataque nucleofílico del grupo OH 3′ libre con el P 5′ del complejo de DNA-P 5′-AMP (flecha verde, paso III) vuelve a sellar la muesca y libera AMP. La reacción enzimática general que convierte DNA con muesca en DNA intacto (E + ATP → E + AMP + 2 Pi) es esquematizada en la parte inferior de la figura. De: Organización, replicación y reparación del DNA, Harper. Bioquímica ilustrada, 30e Citación: Rodwell VW, Bender DA, Botham KM, Kennelly PJ, Weil P. Harper. Bioquímica ilustrada, 30e; 2016 En: http://accessmedicina.mhmedical.com/DownloadImage.aspx?image=/data/books/1814/rodwell_c35_fig-35-018.png&sec=127364382&BookID=1814&ChapterSecID=127364269&imagename= Recuperado: December 31, 2017 Copyright © 2017 McGraw-Hill Education. All rights reserved