UNIVERSIDAD DE CHILE, FACULTAD DE MEDICINA, ICBM, PROGRAMA DE GENETICA HUMANA ASIGNATURA “EVOLUCION” CARRERA DE MEDICINA II AÑO SEMINARIO 1: VIH-SIDA:

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1 UNIVERSIDAD DE CHILE, FACULTAD DE MEDICINA, ICBM, PROGRAMA DE GENETICA HUMANA ASIGNATURA “EVOLUCION” CARRERA DE MEDICINA II AÑO SEMINARIO 1: VIH-SIDA: UN ENFOQUE EVOLUTIVO Virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1): Antecedentes 1) Alto grado de polimorfismo, especialmente en las proteínas del cápside 2) Carácter pandémico de la infección

2 VIH-SIDA En Chile: 6 personas infectadas por día 32.000 portadores de VIH sólo hay 12.000 casos diagnosticados. 80 por ciento son hombres y 20 por ciento mujeres, la mayoría amas de casa que fueron infectadas por sus maridos.

3 VIH-SIDA En Chile: Actualmente reciben tratamiento 100 niños, que fueron infectados por sus madres durante la gestación. También hay preocupación por la cantidad de pequeños huérfanos, quienes han perdido a uno o a sus dos progenitores debido a esta enfermedad. (Fuente: Conasida)‏ A partir de 2001 acceso a terapia antiretroviral por Fonasa, cubriendo al 100% de la población en 2003. Como consecuencia, se ha observado detención de la letalidad de la enfermedad: De un 15% (1993-1997) a un 0.2% (1998-2003)‏

4 INTRODUCCION En este seminario se analizará el patrón de mutación de las proteínas del cápside del VIH, y se aplicarán herramientas básicas de la inferencia filogenética para conocer el modo de infección y transmisión de VIH en casos clínicos. Se utilizará una prueba de ji-cuadrado. Revisar procedimiento guiado por su Profesor ayudante, según el ejemplo  2 = 36.52 0.1316.719.7(O - E) 2 / E 7.3942.51108.9(O – E) 2 2.730.7-33.3O - E 56.3 Valor esperado 169598723Total observado 25272478 13211340 20681151 0340972 13 71351 TotalBase 3= CBase 2= GBase 1= TSitio

5 OBJETIVOS 1) Conocer y analizar el patrón de mutaciones fijadas de las proteínas del cápside del VIH. 2)Discutir la aplicación de los resultados obtenidos al conocimiento de la evolución del virus del SIDA y al manejo de la infección por VIH-1. 3)Interpretar resultados obtenidos del análisis filogenético y aplicarlos al problema de la infección por VIH ACTIVIDAD 1: Exploración de la variabilidad nucleotídica y de su distribución en el segmento codificante de proteínas de la cápside (gp120) del VIH-1*. Su ayudante mostrará en pantalla a 103 cepas del VIH- 1 recogidas de los cinco continentes y de 35 países, ordenadas según la base originaria en cada uno de los sitios nucleotídicos y de acuerdo a las mutaciones hacia las otras tres bases. Los sitios se presentan en orden correlativo y ascendente, según su ubicación en el segmento

6 ACTIVIDAD 2 Para estimar una filogenia a partir de datos de distancias (número de sustituciones nucleotídicas, por ejemplo) se parte del supuesto que las estructuras (secuencias) que comparten un mayor grado de homología (o similitud) se van a encontrar más próximas entre sí en la topología (“árbol”) que resulta del análisis CASO 1 (Ou et al, 1992)‏Ou et al, 1992

7 ACTIVIDAD 2 CASO 2 (Goujon et al 2000)‏ Una mujer de 61 años de edad, VIH negativa, es admitida en un centro hospitalario de los suburbios de París, Francia, a fines de Mayo de 1996, para realizarle una cirugía que no requiere de transfusión sanguínea. En Julio de 1996 sufre una infección primaria por VIH asociada con hepatitis y pérdida significativa de masa corporal. Los análisis bioquímicos (Western blot) confirman la presencia en la sangre de la paciente, de secuencias de RNA viral específico del VIH tipo 1, en muy altas dosis. Los miembros del equipo de cirujanos resultaron VIH negativo, pero dos miembros del equipo de enfermeros para los turnos de noche que estuvieron en contacto con la paciente entre el 28 de Mayo y el 8 de Junio de 1996 resultaron VIH positivos: 1) Un hombre de 30 años de edad, nacido en el Congo, seropositivo para VIH-1 desde 1991, sin tratamiento antiretroviral (Enfermero= N1). En Febrero de 1997, al momento de comenzar a recibir este tratamiento, N1 presenta una carga viral de 10 4 copias por mL. y un conteo de células CD4 + > 500 por mm 3., 2) Una mujer de 51 años de edad, en desconocimiento de su serpositividad para VIH-1 (Enfermera= N2). En Junio de 1996 fue hospitalizada por insuficiencia hepática, asociada con un edema de las extremidades inferiores. Su carga viral para VIH- 1 fue de 1.8 x 10 5 copias por mL. y presentó un conteo de células CD4 + = 94 por mm 3.

8 CASO 2 (Goujon et al 2000)‏