Quiz 1. Nombre al menos uno de los aspectos que se subestima al escoger mal el modelo evolutivo 2. ¿Qué hace la corrección AICc? Bono: ¿Cuál es el segundo.

Presentación del tema: "Quiz 1. Nombre al menos uno de los aspectos que se subestima al escoger mal el modelo evolutivo 2. ¿Qué hace la corrección AICc? Bono: ¿Cuál es el segundo."— Transcripción de la presentación:

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2 Quiz 1. Nombre al menos uno de los aspectos que se subestima al escoger mal el modelo evolutivo 2. ¿Qué hace la corrección AICc? Bono: ¿Cuál es el segundo nombre de Andrew Crawford?

3 Introducción a JModelTest Sistemática Filogenética Laboratorio Luisa A. Castellanos Francisco Gamarra

4 Modelos Evolutivos Independencia de mutación -> Sustitución al azar Sesgos en el tipo de mutación Modelos evolutivos

5 Modelos Jukes Cantor

6 Modelos Kimura de dos parametros α = Transición β = Transversión

7 Modelos Hay Muchos

8 Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma Corrige diferencias en las tasas de sustitucion de nucleotidos

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10 Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma La mayoría de posiciones evolucionan lentamente

11 Tomado de Andrew J. Crawford

12 JModel Test Corre sobre Java Hierarchical y Dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT) Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC) Decision theory method (DT).

13 Corta los nombres Poco tiempo computancional ◦ Se cierra JModel Test

14 Entrega De hoy en ocho antes de las 2:00 p.m