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Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software
Cangar: Análisis de genes implicados en cáncer mediante Reglas de Asociación Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software
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De un vistazo Gen 1 Gen 2 Gen 3 Gen 4 Gen 5 Gen 6
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Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
Índice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
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Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
Índice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
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Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
Índice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
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Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
Índice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
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Definiciones y problema
Microarray Estudio del cáncer
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Descripción del problema
Base de datos con miles de registros Necesidad de sacar algo en claro Demasiados datos para ser analizados por una persona
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Justificación Bioinformática Combatir el cáncer
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Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
Índice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos
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Objetivos del proyecto
Herramienta capaz de encontrar relaciones entre genes Familiarizarse con los algoritmos genéticos Desarrollo web con HTML5 y CSS. Uso de AJAX y librerías JS
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Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
Índice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
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Minería de datos y Reglas de Asociación
Índice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz
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Minería de datos y Reglas de Asociación
Índice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz
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Tareas identificadas Redacción de documentación
Lectura de documentación Diseño del algoritmo Programación Reunión Preparación de la defensa Lectura de documentación de herramientas
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Tiempos empleados
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Presupuesto Rol Coste por hora Director de proyecto 41.91€ Programador junior 11.98€ Horas de desarrollador junior: Horas de jefe de proyecto: 43.41 Total: €
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Coste del proyecto Horas de desarrollador junior: Horas de jefe de proyecto: Presupuesto desarrollador junior: * = € Presupuesto Jefe de proyecto: * = € Total: €
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Objetivos
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Objetivos II
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Objetivos III
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Casos de uso
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Casos de uso II
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Casos de uso III
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Minería de datos y Reglas de Asociación
Índice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz
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KDD
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Reglas de Asociación Básicas: {gen A, gen B} => {gen C}
Cuantitativas: {[1, 2] gen A, [2, 3] gen B} => {[3, 4] gen C}
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Medidas de calidad
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Minería de datos y Reglas de Asociación
Índice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz
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Algoritmo genético
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Algoritmo NSGA-II Frentes de Pareto Distancias
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Diagrama de Componentes
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Tecnología usada
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Interfaz de resultados
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Grafo de resultados
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Tabla de reglas
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Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
Índice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
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Experimentos sobre medidas
Grupo 1 Grupo 2 Grupo 3 Soporte Precisión Factor de certeza Apalancamiento Interés Confianza Ganancia Convicción Netconf Yule’s Q Cobertura
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Rendimiento y distancias
Rendimiento en atributos Rendimiento en individuos
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Resultados obtenidos
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Heatmap
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Volcano plot
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Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
Índice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones
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Conclusiones Algoritmos genéticos muy potentes
Se han cumplido los objetivos Necesidad de colaboración entre distintos campos de la ciencia
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Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software
Cangar: Análisis de genes implicados en cáncer mediante Reglas de Asociación Muchas gracias Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software
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