BIOINFORMÁTICA BIOTECNOLOGÍA BAC – Spinoza 2014. BASES DE DATOS EJERCITACIÓN NCBI.

Presentación del tema: "BIOINFORMÁTICA BIOTECNOLOGÍA BAC – Spinoza 2014. BASES DE DATOS EJERCITACIÓN NCBI."— Transcripción de la presentación:

1 BIOINFORMÁTICA BIOTECNOLOGÍA BAC – Spinoza 2014

2 BASES DE DATOS EJERCITACIÓN NCBI

3 BASES DE DATOS EJERCICIO 1 PubMed La Fenilcetonuria es una enfermedad metabólica causada por la deficiencia de la enzima Fenilalanina hidroxilasa (PAH). En 1985, Kwok et al. lograron generar un cADN de este gen (el cADN es un ADN que se sintetiza a partir del ARNm del gen, mediante técnicas moleculares) y publicaron su hallazgo en la revista Biochemistry. Actividad: Encuentre el Abstract del artículo a partir de la referencia: Biochemistry. 1985 Jan 29;24(3):556-61.

4 BASES DE DATOS

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6  Desde el Abstract en PubMed haga clic en el vínculo Links, que se encuentra arriba a la derecha, justo al lado de Related articles, en la misma línea que la referencia del artículo. De ahí seleccione Nucleotide.

7 BASES DE DATOS

8 Responda:  ¿A qué organismo pertenece?  ¿Quiénes son los autores de los trabajos?  ¿Cuál es el número de referencia en Pubmed?

9 BASES DE DATOS EJERCICIO 2 GenBank Actividad: Desde GenBank acceda a la secuencia X01714.

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12 Responda:  ¿A qué tipo de molécula corresponde?  ¿Cuántos nucleótidos contiene?  ¿En qué fecha se modificó el registro por última vez?  ¿De qué organismo procede?

13 BASES DE DATOS EJERCICIO 3 BLAST Actividad: Ingresar la siguiente secuencia en BLAST. ATGGCGTCGAAGGAGGAGGTGGCCGTGGAGACGGTGGAGGGCGGAG CGGCGGCGGCGAAGGCGCCGTACTGGACCCGCCGCCGGCGCCGCTG CTGGACACGAGCGAGCTGGGTAAGTGGTCGCTGTACCGTGCCCTCAT CGCGGAGTTCATGGCGACGCTCATCTTCCTCTACGTGAGCATCGCCAC CGTGATCGGGTACAAGAACCAGAGGGCCACCGTCGACGCGTGCACCG GCGTCGGCTACCTCGGCGTGGCGTGGTCGTTCGGTGCCACCATAT TCGTCCTCGTCTACTGCACCGGCGGCGTCTCCGGCGGGCACATCAACC CGGCGGTGACGCTGGGCCTCTTCTTCGGGCGGAAGCTGTCGCTCGTC CGCACCGTGCTGTACGTCGTGGCGCAGTGCCTCGGCGCCATCGCC GGCGCCGGCATCGTCGGCACGTTCATCCTCGTCTACACCGTCTTCTCC GCCACCGACCCCAAGCGCACCGCCCGCGACTCCTTCATCCCCGTACTC GTGCCGCTGCCGATCGGGTTCGCGGTGTTCGTCGTGCACCTGGC GACGATTCCGATCACCGGCACGGGCATCAACCCGGCGAGGAGCCTCG GCGCCGCCGTGCTGTACAACCAGCACGCAGCTTGGAAAGACCACTGGA TCTTCTGGGTGGGGCCGGTGATCGGGGCGTTCTTGGCGGCGGCGT ACCACAAGCTGGTGCTGCGCGGCGAGGCCGCCAAGGCGCTCAGCTCG TTCAGGAGCACCAGCGTGACGGCGTGA

14 BASES DE DATOS

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17 Responda:  ¿Qué organismos comparten dicha secuencia?