Descubrimiento de Conocimientos en Bases de Datos de la Biodiversidad: Un ejemplo paradigmático en la ciencia transdisciplinaria Chris Stephens Coordinador.

Presentación del tema: "Descubrimiento de Conocimientos en Bases de Datos de la Biodiversidad: Un ejemplo paradigmático en la ciencia transdisciplinaria Chris Stephens Coordinador."— Transcripción de la presentación:

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2 Descubrimiento de Conocimientos en Bases de Datos de la Biodiversidad: Un ejemplo paradigmático en la ciencia transdisciplinaria Chris Stephens Coordinador de Ciencia Computacional

3 DCBDB IB, ICN, CCADET, IIMAS, otros Mas de 12 investigadores y estudiantes Integración dentro del Macroproyecto(s) SIBA

4 Como funciona la minería de datos? Minería de datos Inteligencia Artificial: redes neuronales, Algoritmos genéticos … Análisis estadístico Conocimiento de dominio

5 Meta: Investigación “trascendente”  Salud Pública Influenza Virus del Nilo Virus Anta Mal de Chagas Gripe Aviar  Agricultura Plagas Especies Invasoras  Medio Ambiente Perdida de Hábitat Cambio Climático Global Entender la dinámica de la biodiversidad a través de la modelación de ecosistemas como sistemas complejos usando minería de datos: incluyendo factores bióticos climatológicos históricos interacciones evolutivos genéticos De lo académico …a lo practico

6 Predicciones: Temporales Distribución de especie(s) A a tiempo t Distribución de especie(s) A a tiempo t’

7 Predicciones: Espaciales A B Conociendo las distribuciones en region A podemos predecirlas en region B?

8 Primeros resultados del proyecto Interacción entre los dos macroproyectos Producto directo de un trabajo en equipo multidisciplinario

9 Formación de la base de datos mas completa de mamíferos Mexicanos (mas de 460 especies) OrdenFamiliaNombreOriginal LONG LAT CarnivoraFelidaePanthera onca-92.337515.2713889 CarnivoraFelidaeLeopardus pardalis-92.337515.2713889 CarnivoraFelidaePanthera onca-92.720555615.3013889 CarnivoraFelidaeHerpailurus yagouaroundi-92.480555615.3394444 CarnivoraFelidaePanthera onca-92.891666715.4416667 CarnivoraFelidaeLeopardus pardalis-96.540277815.6669444 CarnivoraFelidaeLeopardus pardalis-96.490277815.6669444 CarnivoraFelidaeHerpailurus yagouaroundi-92.173611115.9155556 CarnivoraFelidaePanthera onca-93.75516.0863889 CarnivoraFelidaePanthera onca-93.75516.0863889 CarnivoraFelidaeLeopardus pardalis-93.75516.0863889 CarnivoraFelidaeHerpailurus yagouaroundi-93.75516.0863889 CarnivoraFelidaeHerpailurus yagouaroundi-96.466111116.0930556 CarnivoraFelidaePanthera onca-90.941666716.1 CarnivoraFelidaeLeopardus pardalis-90.941666716.1 CarnivoraFelidaeLeopardus wiedii-95.333055616.1666667 CarnivoraFelidaeLynx rufus-95.968055616.2444444 CarnivoraFelidaeLynx rufus-95.968055616.2444444 Predicción y descripción de las distribuciones de 6 especies de Felinos

10 Lynx rufus (Lince)Puma concolor (Puma) Antecedentes Conocimientos de los nichos ecológicos nos dicen donde podemos esperar encontrar un especie Comparten nichos muy similares

11 Leopardus pardalis (Ocelote) Leopardus wiedii (Tigrillo) Pantera onca (Jaguar) Antecedentes Conocimientos de los nichos ecológicos Comparten nichos muy similares

12 Distribuciones actuales

13 Como medir interacciones entre especies? P(especie i ) P(especie i |especie k ) “senal” “ruido” Medición de las interacciones entre dos especies: Epsilon < 0 hay una “repulsión” efectiva entre los especies; Epsilon > 0 hay una “atracción” efectiva entre los especies

14 Como contar interacciones?

15 Resultados Interacciones repulsivas fuertes entre el lince y lo demás Debido a nichos repulsivos? No! El puma comparte el mismo nicho pero NO sufre interacciones repulsivas

16 CONCLUSIONS  Debido a interacciones fuertes de competencia el lince no debe poder existir en lugares donde hay altas concentraciones de tigrillos, ocelotes y jaguares  El puma si debe poder existir

17 “Barrera” predicha para el lince debido a altas concentraciones de tigrillos, ocelotes y jaguares Nicho adecuado para el lince y el puma Los pumas pasan la barrera

18 Conclusiones  Los macroproyectos han dado un marco dentro del cual hay al menos la posibilidad de trabajar en equipo para hacer ciencia trascendente de alto impacto social  Los Macroproyectos de MTUIC y SIBA han logrado una integración horizontal notable a través del proyecto de Minería de datos en Bases de datos de la Biodiversidad  Este proyecto, junto con otros en el Macroproyecto, muestra las sinergias posibles que se puede lograr a través de trabajo en equipo multidisciplinario  En poco tiempo, por apalancar los conocimientos, experiencias, conceptos y técnicas de este grupo se ha encontrado resultados novedosos, innovadores y alentadores para investigaciones futuras.

19 Camila González - Instituto de Biología Carlos Ibarra - Instituto de Biología Juan Carlos Chacón - Instituto de Biología Joaquín Giménez - UNIBIO Jaime Rodríguez- UNIBIO Omar Miranda - UNIBIO Nicolas Kemper Valverde - CCADET Víctor Sánchez Cordero – Instituto de Biología Christopher Stephens – ICN Luis Ochoa Toledo - CCADET Participantes Ana Estela Ruiz - IIMAS