Red Académica i2basque HPC Josu Aramberri Iñaki Serna II Workshop.

Presentación del tema: "Red Académica i2basque HPC Josu Aramberri Iñaki Serna II Workshop."— Transcripción de la presentación:

1 Red Académica i2basque HPC Josu Aramberri (jaramberri@i2basque.es)jaramberri@i2basque.es Iñaki Serna (iakiserna@ej-gv.es)iakiserna@ej-gv.es II Workshop Ibercivis CIEMAT, 13 de septiembre de 2011

2 Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid 2011 ¿QUIÉNES SOMOS? I2basque es una REN autonómica, financiada por el Departamento de Educación, Universidades e Investigación del Gobierno Vasco. Desde Enero del 2011 somos parte de IkerBasque – Fundación Vasca para la Ciencia Proporcionamos comunicaciones avanzadas y servicios TIC a los agentes de la Red Vasca de Ciencia y Tecnología:  Universidades públicas y privadas  Centros Científicos y Tecnológicos  Hospitales e investigación biomédica  Entidades gestoras de I+D Áreas en las que desarrollamos nuestra actividad:  Comunicaciones  Cálculo intensivo  Multimedia y Videoconferencia  Contenidos en Internet: LMS, CMS

3 RECURSOS HPC IBM iDataplex  128 nodos, 1024 procesadores  90 TB disco, 8.2 TB RAM  11TFlops  Infiniband  Torque + Moab  RHEL 5.2  Próxima incorporación a la RES Cluster gt3  29 nodos, 232 procesadores  12 TB disco, 458 GB RAM  1378 GFlops  Gigabit Ethernet  Sun Grid Engine  CentOS 5.3  Cluster gt 16 nodos, 66 procesadores 12 TB disco, 67 GB RAM Gigabit Ethernet Sun Grid Engine CentOS 4.4 Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid 2011

4 Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid 2011 Mecanismos de acceso y grupos que pueden acceder  Pueden solicitar recursos las entidades afiliadas a i2basque, enviando el formulario especificado en nuestra página web a grid@i2basque.es http://i2basque.es/index.php/Cálculo_intensivo Valores de peticiones y accesos  Número de usuarios: 24 repartidos entre los clusters  Peticiones entre 8 y 256 procesadores Otros recursos  IBERCIVIS: conexión de los KZgunes

5 Conexión con IBERCIVIS Servidor intermedio  Pasarela entre la red de los KZgune (10.x.x.x) y la Red Académica  Garantizar el tráfico de entrada/salida del cliente BOINC

6 Conexión con IBERCIVIS Situación actual  Pasarela configurada y en fase de pruebas  Cliente BOINC preconfigurado para instalación piloto  Verificación del control del tráfico con Ibercivis (ida y vuelta)  En fase de instalación en un parque de 2.400 equipos Retos  Balanceado de tráfico con distintos servidores/aplicaciones  Tiempo de actividad de los equipos en los KZgunes Jornada laboral 24 * 7

7 Aplicaciones en el País Vasco Caso de CIC Biogune (Adriana Rojas) Aplicación  Investigación en cáncer de hígado  Docking de proteinas  Ahora usan Autodock  Adaptación a Ibercivis: Neurosim-Gromacs  Calendario: noviembre-diciembre Retos  2 millones de comparaciones => 5 minutos  Alternativas BD de proteinas (1-2 millones en la BD, ficheros.pdb de proteínas) Librerías comerciales: 1.500 compuestos (fichero + polvos)

8 Ibercivis en el País Vasco Petición ciudadana  Petición de ideas del Gobierno Vasco  Administración abierta, concepto asociado a OpenGov  Incorporación a IBERCIVIS atendiendo una idea recibida por este canal Otros temas relacionados  Necesitamos especialistas en HPC  Propuesta de master, incluyendo uso de Ibercivis  Proyectos de master en aplicaciones Ibercivis

9 Ibercivis y el Dianemólogo Un invento de Leonardo Torres Quevedo  Patentado en 19071907  Un nuevo procedimiento destinado a copiar sin necesidad de acudir a la taquigrafía un discurso a medida que se pronuncia.  Utilizado en el Ateneo de Madrid en una conferencia de Amós Salvador titulada “La velocidad de la luz” Antecedente simbólico de Ibercivis  Distribuye las frases de conferenciante entre varios copistas (8 a 12)  Cada frase es una work-unit (wu), que se anota en una ficha  Reuniendo las fichas ordenadas se obtiene la transcripción del discurso