Genome-Wide Analysis of the Core DNA Replication

Presentación del tema: "Genome-Wide Analysis of the Core DNA Replication"— Transcripción de la presentación:

1 Genome-Wide Analysis of the Core DNA Replication
Machinery in the Higher Plants Arabidopsis and Rice Randall W. Shultz2, Vinaya M. Tatineni, Linda Hanley Bowdoin*, and William F. Thompson Arabidopsis thaliana Arroz (Oryza sativa) Denise Raddatz Mota

2 Replicación del ADN en Eucariontes
Numerosos complejos de multiproteínas. - Iniciación - Elongación - Maduración de los fragmentos de Okasaki

3 ¿Qué se sabe sobre la Maquinaria de la Replicación del ADN?
> Levaduras Modelo Animal Plantas Combinación de información experimental publicada con análisis bioinformáticos de la secuencia genómica en Arabidopsis y arroz.

4 Estrategia Ensamblaje de base de datos a partir de las proteínas (maquinaria de replicación del ADN) de levadura y animal. Se obtuvo la base de datos del genoma traducido de Arabidopsis con el algoritmo BLAST. Las secuencias de Arabidopsis se utilizaron para encontrar homólogos en arroz. Para el análisis filogenético de las proteínas se utilizó el programa ClustalW. Para el alineamiento de las múltiples secuencias de complejos de proteína se utilizó el algoritmo ClustalW.

5 Maquinaria de la Replicación del ADN en Eucariontes

6 Pre-iniciación Complejo de pre-replicación (pre-RC):
ORC1-6 + CDC6 + MCM2-7

7 Iniciación Supercomplejo con función de helicasa: GINS + MCM2-7 +CDC45

8 Elongación GINS + MCM2-7 +CDC4 5 + Pol E

9 Maduración Fragmentos de Okasaki: Pol D + FEN1 + LIG 1 + PCNA

10 Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Pre-Iniciación

11 Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Iniciación

12 Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN
en la Elongación

13 Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN
en la Elongación

14 Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Maduración

15 Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína ORC6

16 Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF1

17 Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF2

18 Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF3

19 Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína SLD5

20 PSF1 PSF2 PSF3 SLD5

21 Múltiples Copias de Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN
GENE Humano Levadura Arabidopsis Arroz ORC CDC CDT CDC TOPBP PSF POLD POLE POLE POLE GF GF POLE GF GF PCNA RPA RPA RPA FEN LIG

22 Conclusiones La maquinaria de replicación del ADN de animales y levaduras, está conservada en plantas, mostrando muchas características en común con otros eucariontes y otras que son únicas en plantas. Las proteínas de replicación del ADN en plantas, son más similares a las del humano que a las de levaduras. Los modelos animales pueden ser más importantes para el estudio de replicación del ADN en plantas que los de levadura.