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BASES DE DATOS BIBLIOGRÁFICAS: PUBMED diciembre 2011
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ÍNDICE 1.- Introducción 2.- Iniciando una búsqueda 3.- Formatos de referencias 5.- Archivar los resultados 6.- Limitar los resultados 4.- Sugerencias para la búsqueda
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¿Qué es una base de datos? ¿Referencias? ¿Números? ¿Estadísticas?
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DEFINICIÓN DEFINICIÓN campos (fields) información homogénea organizada ordenador Conjunto de información homogénea organizada de una forma determinada y legible por ordenador registros (records)
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Introducción 1
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¿Qué es MEDLINE- PubMed?
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- Una base de datos de la National Library of Medicine - Especializada en ciencias de la salud - Integrada por más de 20 millones de referencias - Con información bibliográfica desde 1865 - Y accesible desde http://www.pubmed.com
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¿Qué me encuentro en PubMed?
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Bases de datos
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Formulario de consulta
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Herramientas y recursos
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Información
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Para comenzar, debe asegurarse......que la base de datos seleccionada es PubMed
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...en el menú desplegable del comando Search. Puede consultar otras bases de datos disponibles, además de PubMed...
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Iniciando una búsqueda 2
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¿Cómo comenzar a buscar? ¿Fibromialgia?
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Por ejemplo: fibromyalgia 1 Debe escribirse el término de la búsqueda en inglés
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Para ayudarle en la escritura del término, se despliega un menú......con términos similares al que se pretende consultar
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Activar el comando “Search” 2
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Al consultar “fibromyalgia”......las primeras de las cuales pueden visualizarse en la misma pantalla 3...resultan 6.618 referencias...
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¿Puedo combinar términos? ¿Fibromialgia Y ejercicio?
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OPCIÓN “A PRIORI” booleanos: ANDOR NOT Para combinar los términos deben utilizarse los operadores booleanos: AND, OR y NOT mayúsculas separados Éstos deben escribirse en mayúsculas y separados de los términos
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Se escribe el primer término (fibromyalgia)...
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...luego el operador AND...
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...y después el segundo término (exercise)
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Recuperándose en total 598 referencias fibromyalgia AND exercise
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OPCIÓN “A POSTERIORI” independientemente Consiste en buscar independientemente cada término “History” Utilizar luego la función “History” con el ratón Y, por último, combinar los términos seleccionando los booleanos con el ratón
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Se busca el primer término (fibromyalgia)...
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Recuperándose 6.618 referencias relacionadas con este término
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A continuación se busca el segundo término (“exercise”)
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Recuperándose 232.582 referencias relacionadas con este otro término
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Por último, se accede desde la función “Advanced” (Búsqueda avanzada)...
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...a la función “History”......para consultar los resultados de ambas búsquedas...
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Ahora, puede construirse también la estrategia de búsqueda de otra forma......pinchando sobre el número previo al primer término
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…se despliega un menú, donde debe seleccionarse la primera opción (AND)...
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...para que se inserte en el formulario el número del primer elemento de la estrategia
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Después, es necesario pinchar sobre el número del segundo término...
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Y en el menú, seleccionar de nuevo el operador AND...
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...para que el segundo término se incorpore al formulario de consulta (“PubMed Advanced Search Builder”)
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Por último, al activar el comando “Search” se ejecuta la búsqueda
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Recuperándose, igualmente, 598 referencias
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¿Cómo seleccionar una referencia? la referencia Me interesa nº 4
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Puede seleccionarse una determinada referencia (o más de una)......marcando con el ratón el cuadro en blanco...
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...situado delante del número de la referencia.
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¿Por qué veo sólo 20 referencias? 20 referencias, 100 páginas
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Por defecto, no pueden verse en pantalla todas las referencias (598, en este caso) de una sola vez...
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…sino sólo las 20 primeras......dispuestas en sucesivas páginas
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¿No puedo ver más referencias en pantalla? ¡¡TODAS!!
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“Display Settings” Para ver más referencias, es necesario activar la función “Display Settings”
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...y luego seleccionar en “Items per page, una opción entre 5 y 200 referencias “Items per page”
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Al elegir, en “Items per page”, la opción de 200......y activar el botón “Apply”
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...se reagrupan las 598 referencias en sólo tres páginas
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Formatos de referencias 3
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¿Cómo puedo ver los abstracts?
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Por defecto, las referencias se presentan en el formato “Summary”... Formato “Summary”
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“Summary” Formato “Summary” (sumario) : autor título del artículo revista y paginación estado de la cita (ej. en proceso) idioma (si no es inglés) identificador PubMed (PMID) artículos relacionados
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Formato “Summary” AutoresTítulo (en inglés)Idioma Artículos relacionados Revista PMID Estado Formato “Summary”
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Para ver, por ejemplo, el resumen de las referencias...
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...es necesario activar en la función “Display Settings”...
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... el formato “Abstract”
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...en su versión HTML (“Abstract”) Resumen
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...o en su versión texto (“Abstract Text”) Resumen
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“Abstract” Formato “Abstract” (resumen) : autor y lugar de trabajo título del artículo revista y descripción física estado de la cita idioma (si no es inglés) resumen y PMID
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Formato “Summary” Título (en inglés)RevistaIdiomaAutoresLugar de trabajo Resumen PMIDEstado
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¿Y un formato para ver las materias? ¿Cómo puedo ver los MeSH?
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Desde el formato “Abstract”......seleccionando el botón + de la sección Publication Types, MeSH Terms...
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...se despliegan automáticamente......primero, el “tipo de artículo”......y luego los “términos MeSH”.
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¿Cómo están ordenadas las referencias? ¿1, 2, 3, 4, 5, 6, etc.?
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Por defecto, las referencias se ordenan cronológicamente......según se han incorporado a la base de datos (“Sorted by Recently Added”)
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Al principio, las recién incorporadas...
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...y, al final, las más antiguas
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¿Puedo elegir otras ordenaciones? ¿Por ejemplo, por arevista?
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“Display Settings” Para seleccionar otras formas de ordenar, es necesario activar la función “Display Settings”
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...y luego seleccionar una de las opciones en “Sort by” “Sort by”
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...fecha de publicación (“Sorted by Pub Date”)
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...primer autor (“Sorted by First Author”)
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...Revista (“Sorted by Journal”)
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...o por Título del artículo (“Sorted by Title”)
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Sugerencias a la búsqueda 4
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¿Para qué sirve toda la información a la derecha? ¿Free? ¿Review? ¿PubMed sssCentral?
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En cada búsqueda, PubMed muestra, en su margen derecho,......una serie de sugerencias o complementos
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Filtrar los resultados - artículos de acceso libre al texto completo - o artículos de revisión A
83
Otros términos sugeridos (“Related searches”) para perfilar y reelaborar la búsqueda B
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Artículos que incluyen en su título los términos de la búsqueda C
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Artículos de acceso libre al texto completo desde PubMed Central D
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Archivar los resultados 5
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¿Cómo puedo guardar las referencias? ¿ Las tengo que aprender todas sssde memoria?
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Comando “Send to” El comando “Send to” permite guardar las referencias de diferentes formas
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La opción “Send to” + “ File”......permite guardar las referencias (“Create File”) en un archivo...
90
…pudiendo indicar previamente......el formato (“Format”)...... y la ordenación (“Sort by”) de las referencias...
91
Al pulsar el botón “Create File” (Crear archivo)...
92
…aparece una nueva ventana con el nombre del archivo creado Por defecto: “pubmed_result.txt”
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Al pulsar “Guardar”......se archiva el resultado de la búsqueda
94
La opción “Send to” + “E-mail”......permite enviar las referencias mediante un correo electrónico...
95
…pudiendo indicar previamente......y la dirección a donde enviarlo...el formato (“Format”)......la ordenación (“Sort by”)...el número de referencias a enviar (“Number to send”)
96
...una vez cumplimentado el formulario......y activado el botón “e-mail” El resultado de la búsqueda es enviado...
97
La opción “Send to” + “Clipboard”......permite enviar las referencias a un archivo virtual (“Add to Clipboard”)...
98
...con una capacidad máxima de 500 referencias (luego, en este caso, 98 se quedarían fuera)
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...y al que se accede desde el icono y la función “Clipboard”...
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...para consultar las referencias guardadas provisionalmente (un máximo de 500)...
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...eliminar aquellas que no nos interesan (“Remove from clipboard”)...
102
...guardar las restantes aplicando la función “Send to”...
103
...o eliminarlas todas a la vez (“Remove all items”)
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Una última opción ers archivar la propia estrategia de búsqueda (“fibromyalgia AND exercise”) para aprovecharla en un futuro
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Para ello basta con activar la función “Save search”
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PubMed le solicitará entonces una clave y contraseña personales
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Si no las tiene puede obtenerlas registrándose de forma individual (“Register for an account”)
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Al introducir su clave y contraseña personales, PubMed le permite guardar la estrategia. Para ello…
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…primero debe darle un nombre …y luego activar el botón “Save”
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Puede defnir el envío de alertas periódicas a su correo electrónico
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O no, si no es partidario de que le “bombardeen” periódicamente con dichas alertas
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Finalmente, debe pulsar la función “Save” para que su estrategia quede guardada.
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En su página personal en PubMed
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¿Cómo recuperar la estrategia guardada? Sí, pero, ¿y dónde se ha quedado?
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Para recuperar la estrategia guardada, basta con ir a My NCBI…
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…activar la clave y contraseña personales…
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…buscar la estrategia en la sección “Search Save”…
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…y pinchar sobre el título de la misma para que automáticamente se ejecute en PubMed
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Limitar los resultados 6
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¿Qué puedo hacer si obtengo muchos resultados? ¡¡No puedo leerme 138.521 referencias!!
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Desde la página principal, en la columna de la izquierda, tenemos las opciones para limitar la búsqueda
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…para reducir el número de resultados de la búsqueda …pueden activarse diversos filtros..
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1.- Tipo de artículo Hacienco clic sobre “more”, visualizamos todos los tipos de documento
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2.- Disponibilidad del texto
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2.- Fecha de publicación Se puede personalizar el rango
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3. Sujetos de la investigación
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Al hacer clic con el ratón sobre una o varias de las opciones, quedan marcadas
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Aquí también visualizamos los filtros activados…
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Y si seleccionamos: Mostrar filtros adicionales…
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… obtenemos más filtros para incluir en la búsqueda Se pueden marcar uno o varios…
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… y visualizarlos en la página principal
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Así, una búsqueda como la de “fibromyalgia AND exercise”......acotada en función de diferentes filtros
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… recupera 74 referencias, reduciendo el número inicial
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BASES DE DATOS BIBLIOGRÁFICAS: PUBMED - Búsquedas sencillas - Formatos referencias - Guardar referencias - Limitar resultados
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CRÉDITOS Este tutorial ha sido realizado por el Grupo de Investigación del Proyecto ETS PI07/90103: Investigador principal: José Manuel Estrada Lorenzo (Agencia Laín Entralgo) Investigadores: Concepción Campos Asensio (Hospital Universitario de Getafe) Isabel Martínez Hervás (Hospital Severo Ochoa) Juan Medino Muñoz (Hospital Universitario de Fuenlabrada) Concepción Muñoz Tinoco (Hospital Universitario Ramón y Cajal) Olga Reillo Sánchez (Agencia Laín Entralgo) María José Toledano (Hospital Infanta Cristina) Teresa de la Torre Aragonés (Hospital Infanta Leonor) Asesores: Ana Barderas Manchado (Instituto de Salud Carlos III) Blanca Novella (Agencia Laín Entralgo) Ilustraciones: Eduardo Estrada Lorenzo Financiación: Fondo de Investigaciones Sanitarias
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