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De DNA a proteína
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Los genes se expresan con diferente eficiencia
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El mecanismo de transcripción
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Diferentes clases de ARN´s
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Transcripción en bacterias
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Initiation Elongation Termination
The promoter functions as a recognition site for transcription factors The transcription factors enable RNA polymerase to bind to the promoter forming a closed promoter complex Following binding, the DNA is denatured into a bubble known as the open promoter complex, or simply an open complex Elongation RNA polymerase slides along the DNA in an open complex to synthesize the RNA transcript Termination A termination signal is reached that causes RNA polymerase to dissociated from the DNA
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La cadena codificante tiene la misma secuencia
que el transcrito
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Carácterísticas del promotor
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Los promotores tienen orientación
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La dirección de la transcripción de los genes
puede variar en el cromosoma
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La ARN polimerasa es la encargada
de copiar el ADN
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Factores sigma (s)
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Existen diferentes estados en la iniciación
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Elongación de la cadena
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URNA-ADNA apareamiento es débil La RNA polimerasa se detiene
Terminación de la transcripción terminadores intrínsecos NusA URNA-ADNA apareamiento es débil No se necesita una proteína para remover físicamente a la RNA polimerasa del DNA La RNA polimerasa se detiene
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La proteína Rho es una helicasa
Terminadores dependientes de Rho rho utilization site La proteína Rho es una helicasa sitios rut Note: This is an intrastrand RNA:RNA interaction (folding stabilized by H-bonding of A-U and C-G)
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Mensajes policistrónicos
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Estructura de los mRNA
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Transcripción en eucariontes
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ARN polimerasas Structure of a bacterial RNA polymerase
Structure of a eukaryotic RNA polymerase II
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Diferentes tipos de ARN polimerasas
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Generalmente una adenina
Los promotores eucariontes también tienen sitios consenso Generalmente una adenina El núcleo del promotor es relativamente corto consiste de la caja TATA, quién es importante para determinar el sitio preciso del inicio de la transcripción El núcleo del promotor por sí mismo produce una transcripción de bajo nivel conocida como transcripción basal
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Transcripción basal (factores de transcripción)
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TFIIH plays a major role in the formation of the open complex
A close complex TFIIH plays a major role in the formation of the open complex It has several subunits that perform different functions One subunit hydrolyzes ATP and phosphorylates a domain in RNA pol II known as the carboxyl terminal domain (CTD) This releases the contact between TFIIB and RNA pol II Other subunits act as helicases Promote the formation of the open complex Released after the open complex is formed RNA pol II can now proceed to the elongation stage
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Factores de transcripción
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Proteínas activadoras de la transcripción
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Procesamiento del ARN
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Adición del CAP La fosfatasa remueve un fosfato del 5´
2) Una guanil transferasa agrega GMP 3) Una metil transferasa agrega un grupo metilo
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Intrones del grupo I y II (autocatálisis)
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Genes estructurales En eucariontes, la transcripción de genes estructurales produce un transcrito largo conocido como pre-mRNA ó RNA heterogéneo nuclear (hnRNA) Este RNA es alterado por corte y otras modificaciones antes de salir del núcleo. El corte requiere de la ayuda de un multicomponente estructural conocido como “espliceosoma”
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Existen secuencias específicas en los límites exón-intrón
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Intron loops out and exons brought closer together
Moléculas de RNA-proteína (snRNP) son las responsables del corte Intron loops out and exons brought closer together
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Intron will be degraded and the snRNPs used again
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Puede existir corte alternativo en los genes
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El corte alternativo puede producir varias isoformas
a partir de un gen
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Terminación (Poliadenilación)
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El RNA es cortado y la enzima
Poli-A polimerasa (PAP) agrega A´s
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Proteínas de unión al poli-A
se unen al extremo 3´ hasta que el mensaje sale del núcleo
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