UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN CRISTÓBAL DE HUAMANGA ESCUELA DE POSGRADO FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS MAESTRÍA EN CIENCIAS – MENCIÓN MICROBIOLOGÍA CURSO:

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1 UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN CRISTÓBAL DE HUAMANGA ESCUELA DE POSGRADO FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS MAESTRÍA EN CIENCIAS – MENCIÓN MICROBIOLOGÍA CURSO: BIOINFORMATICA TEMA: HAMMER: Análisis de Biosecuencia utilizando modelos ocultos de Markov INTEGRANTES: AYALA SALINAS, Alexander OSCCO CORAHUA, Lusber

2 https://www.ebi.ac.uk/

3 EMBL-EBI: ¿por qué es importante? Comprender cómo la genética afecta la salud de los seres humanos, las plantas y los animales es esencial para los avances en la prevención de enfermedades, la seguridad alimentaria y la biodiversidad. Colaboramos con científicos e ingenieros de todo el mundo y proporcionamos la infraestructura necesaria para compartir datos abiertamente en las ciencias de la vida.

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5 Las búsquedas de homología rápida de proteína sensible utilizando modelos de Markov ocultos por perfil (HMM) El objetivo es determinar los parámetros desconocidos (u ocultos, de ahí el nombre) de dicha cadena a partir de los parámetros observablesobservables

6 uso de la línea de comando de la herramienta uso de HMMER a través de este sitio web, al que se puede acceder utilizando la interfaz web o la interfaz del programa de aplicación (API). La completa documentación de la línea de comandos proporciona información general sobre los HMM de perfil y los detalles de los diferentes algoritmos, además de proporcionar una descripción de todas las opciones disponibles. Este sitio web proporciona acceso a los mismos algoritmos y pone a disposición las opciones de línea de comando más utilizadas. Los resultados de la línea de comandos y las versiones del sitio web de HMMER son idénticos para una consulta, base de datos y opciones determinadas. Sin embargo, el sitio web proporciona vistas adicionales de los resultados para permitir un análisis más profundo, usando solo unos pocos clics del mouse.

7 El servidor web HMMER: búsquedas de homología rápidas y sensibles. Este sitio ha sido diseñado para proporcionar búsquedas casi interactivas para la mayoría de las consultas, junto con visualizaciones de resultados intuitivos e interactivos.

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10 Tirosina quinasa

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