Master “Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad” Asignatura: Ecoinformática Dic. 2010 Seminario Práctico Introducción a los Metadatos.

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1 Master “Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad” Asignatura: Ecoinformática Dic. 2010 Seminario Práctico Introducción a los Metadatos en Ecología. Edición de Metadatos con Morpho Antonio Jesús Pérez Luque sl.ugr.es/ajpelu_metadatos_master2010_pr

2 1. Introducción Definiciones  Información sobre los datos “datos sobre los datos”  Información de nivel superior que describe el contenido, calidad, estructura y accesibilidad de un conjunto específico de datos. (Michener et al., 1997)

3 2. Objetivos 932 Datosmetadatosdatapackage Documentar un conjunto de datos con el estándar de metadatos ecológicos EML (Ecological Metadata Language) utilizando un editor de Metadatos (Morpho). Crear un paquete de datos documentados, validarlos e incluirlo en un catálogo de metadatos accesible a la comunidad científica.

4 3. Herramientas i.Conjunto de datos file: Observaciones.csv directory: /home/ecoinformatica ii.Editor de Metadatos Morpho: http://knb.ecoinformatics.org/morphoportal.jsp http://knb.ecoinformatics.org/morphoportal.jsp iii.Validador de Metadatos EML Parser: http://knb.ecoinformatics.org/emlparser/ http://knb.ecoinformatics.org/emlparser/ iv.Catálogo de Metadatos Metacab-KNB (The Knowledge Network for Biocomplexity) https://knb.ecoinformatics.org/knb/ Metacab-iEcolab (Laboratorio de Ecología del CEAMA) http://metacat.iecolab.es/knb/

5 3. Herramientas: Datos i.Conjunto de datos file: Observaciones.csv directory: /home/ecoinformatica obs_idaniomesvalorvariable estacion_id 11984422.30precip1 21984578.20precip1...... 183197553.40tmin2 184 197568.00 tmin2...... 6991995923.90tmax2 70019951020.90tmax2

6 3. Herramientas: Morpho ii.Editor de Metadatos: Morpho  Plataforma que permite a los ecólogos crear y organizar los metadatos y los datos y almacenarlos localmente y/o compartirlos en red.  Tanto los datos como los metadatos pueden ser buscados y recuperados, localmente y en la red  Permite compartir datos, estrcuturandolos bajo una estructura común (estándar EML)  Utiliza el formato XML...  Es un editor XML  15 pasos - Para cada paso se describe la información que se ha de rellenar  Existencia de campos requeridos (en rojo)

7 3. Herramientas: Morpho Primeros pasos: Creación de 1 perfil Datos  Nombre de perfil: ecoinf_iecolab  Nombre: Iecolab  Apellido: Practicas Ecoinformatica  Organización: Unaffiliated

8 3. Herramientas: Morpho Primeros pasos: identificador El nombre que elijamos se usará para nombrar todos los datapackage creados con este perfil. Cada nodo (centro de investigación) tiene un nombre asignado (ej. Red LTER-US)

9 3. Herramientas: Morpho Primeros pasos: Trabajo en local o conexión al servidor (catálogo) Para acceder a la red hemos de estar registrados en KNB http://knb.ecoinformatics.org/ Username: ecoinf_iecolab Organization: ecoinf_iecolab Password: ecoinf_iecolab

10 3. Herramientas: Morpho Inicio

11 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 1 Creación de un paquete de datos

12 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 2 Título y Abstract

13 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 3 Keywords

14 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 4 Información relativa a los responsables de los datos

15 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 5 Propietario del paquete de datos

16 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 5 Propietario del paquete de datos

17 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 6 Contacto de los metadatos del paquete de datos

18 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 7 Partes asociadas al paquete de datos

19 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 7 Partes asociadas al paquete de datos: identificar “rol”

20 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 8 Información sobre el proyecto

21 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 9 Derechos de uso del paquete de datos.

22 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 10 Coberturas: geográfica

23 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 10 Coberturas: geográfica

24 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 11 Coberturas: temporal

25 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 11 Coberturas: temporal

26 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 12 Coberturas: taxonómica

27 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 13 Metodologías

28 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 14 Acceso a la información

29 3. Herramientas: Morpho. Creación de datapackage. 15 Introducir metadatos sobre la tabla de datos

30 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 1 Describir la tabla de datos

31 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 2 Importar estructura de la tabla de datos

32 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 4 Importar estructura de la tabla de datos

33 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 5 Importar estructura de la tabla de datos

34 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 6a Descripción de los atributos

35 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 6b Descripción de los atributos

36 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 6c Descripción de los atributos

37 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 6d Descripción de los atributos

38 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 7 Vista datos

39 3. Herramientas: Morpho. Documentacion de la Tabla. 7 Vista final metadatos

40 3. Herramientas. Validador EML iii.Validador de Metadatos EML Parser: http://knb.ecoinformatics.org/emlparser/ http://knb.ecoinformatics.org/emlparser/

41 3. Herramientas. Catálogos de Metadatos iv.Catálogo de Metadatos Metacab-KNB (The Knowledge Network for Biocomplexity) https://knb.ecoinformatics.org/knb/ Metacab-iEcolab (Laboratorio de Ecología del CEAMA) http://metacat.iecolab.es/knb/ Conectar desde Morpho con el catálogo de metadatos Archivo -> Establecer Preferencias Metacar-URL -> dirección del catálogo de metadatos http://metacat.iecolab.es/knb/metacat https://knb.ecoinformatics.org/knb/metacat Conectar desde Morpho con el catálogo de metadatos Archivo -> Guardar - Localmente - En red

42 3. Herramientas. Catálogos de Metadatos iv.Catálogo de Metadatos Metacab-KNB (The Knowledge Network for Biocomplexity) https://knb.ecoinformatics.org/knb/ Metacab-iEcolab (Laboratorio de Ecología del CEAMA) http://metacat.iecolab.es/knb/

43 Cualquier duda, me podéis encontrar en: ajperez@ugr.es iecolab.es/ajpelu ajperezluque.blogspot.com @ajpelu scribd.com/ajpelu Presentaciones: Pérez-Luque, A.J. (2010). Introdución a los metadatos en Ecología. Seminario de la Asignatura Ecoinformática. Master “Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad”, Dic-2010. Disponible en: http://sl.ugr.es/ajpelu_metadatos_master2010 Pérez-Luque, A.J. (2010). Introdución a los metadatos en Ecología. Edición de Metadatos con Morpho. Seminario Páctico de la Asignatura Ecoinformática. Master “Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad”, Dic-2010. Disponible en: http://sl.ugr.es/ajpelu_metadatos_master2010_pr Texto: Pérez-Luque, A.J. (2010). Introdución a los metadatos en Ecología. Seminario de la Asignatura Ecoinformática. Master “Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad”, Dic-2010. Disponible en: http://sl.ugr.es/ajpelu_metadatos_master2010texto Gracias por la atención!!