La identificación bioquímica (IB) clásica de las bacterias anaerobias (BA) tiene una resolución insuficiente para la identificación de la gran variedad.

Presentación del tema: "La identificación bioquímica (IB) clásica de las bacterias anaerobias (BA) tiene una resolución insuficiente para la identificación de la gran variedad."— Transcripción de la presentación:

1 La identificación bioquímica (IB) clásica de las bacterias anaerobias (BA) tiene una resolución insuficiente para la identificación de la gran variedad de estos microorganismos, potencialmente patógenos para el hombre. Por lo tanto, la IB agrupa dentro de la misma especie a microorganismos en realidad diferentes y es incapaz de identificar a otros, llevando a una considerable simplificación de la etiología de las infecciones por BA. INTRODUCCION En el presente estudio se ha determinado el desempeño de la espectrometría de masas (EM) MALDI- TOF para la identificación de aislamientos clínicos y ambientales de BA, en comparación con las técnicas bioquímicas y usando como referencia la secuenciación del gen 16S ARNr. CONCLUSIONES MATERIALES Y METODOS Se analizaron 43 aislamientos de bacterias anaerobias mediante el sistema API 20A (bioMèrieux) y la plataforma EM MALDI-TOF, utilizando la base de datos Biotyper 3.0. En todos los casos se usó como "gold standard" la secuenciación del gen 16S ARNr. Score 1.9 género y especie. 0046 DESAFIO DE LA IDENTIFICACION POR ESPECTROMETRIA DE MASAS MALDI-TOF FRENTE A BACTERIAS ANAEROBIAS R Callejo, F Rocca, C Martínez, L Aguerre, L Cipolla, M Prieto SERVICIO BACTERIOLOGIA ESPECIAL INEI ANLIS DR. CARLOS G. MALBRAN, ARGENTINA OBJETIVO RESULTADOS Id. API 20AId. MALDI-TOF (score) Id. SECUENCIACION 16 ARNr sin identificaci ó n Finegoldia magna 2,2Finegoldia magna Clostridium sp.C. cochlearium 2,4C.cochlearium Clostridium botulinum/sporogenesC. sardiniense 1,7C. baratti Clostridium histolyticumC, septicum 2,3C. septicum Clostridium histolyticumC. sporogenes 1,6C. sporogenes Clostridium perfringens (2)C. perfringens 2,2-2,4C. perfringens Clostridium bifermentansC. perfringens 2,4C. perfringens Clostridium difficile (10)C. difficile 1,7- 2,3C. difficile Clostridium beijerinckii /C. butyricumCl. tertium 2,1C. tertium Clostridium sp.C. butyricum 2,2C. amygdalinum Lactobacillus sp.L. delbrueckii 2,3L. delbrueckii Lactobacillus acidophilus / L. jenseniiL. gasseri 2,7L. gasseri Lactobacillus sp. (3)Lactobacillus 1,3L. fermentum Actinomyces sp.P. acnes 2,1P. acnes Propionibacterium sp (3)P. acnes 2,0P. acnes Id. API 20AId. MALDI-TOF (score) Id. SECUENCIACION 16 ARNr Propionibacterium avidumP. avidum 1,7P.avidum Eubacterium /ActinomycesP.granulosum 1,9P.granulosum Actinomyces sp.A. turicensis 2,1A. turicensis Actinomyces israeliiA. israelii 2,0A. israelii Actinomyces neuii subsp. neuii (API Coryne)A. neuii 2,0A. neuii subsp. neuii Actinomyces turicensis/ Actinobaculum schaaliiA. schaalii 1,8A. schaalii Actinomyces naeslundiiA. naeslundii 2,1A. naeslundii Actinomyces sp.A. radingae 2,0A. radingae Gemella morbillorumA. odontolyticus 1,7A. odontolyticus Actinomyces sp.A. urogenitalis 2,2A. urogenitalis Bacteroides fragilis (2)B. fragilis 2,3B. fragilis Bacteroides caccaeB. caccae 2,2B. caccae Bacteroides caccaeB.thetaiotaomicron 2,0B. thetaiotaomicron Fusobacterium necrophorum /F. nucleatumF. naviforme / F nucleatum 2,0F. nucleatum Fusobacterium sp.F. naviforme 2,3F. nucleatum El método fenotípico y la EM coincidieron a nivel de especie en un (20/43) 47%, por lo tanto 23 aislamientos fueron incorrectamente identificados por el perfil bioquímico. La secuenciación respaldó la identificación por EM a nivel de especie en 36 casos (84%) y en 7 casos (16%) identificó género correcto y especie incorrecta o sólo género correcto. Los datos obtenidos en este estudio demuestran que la EM ofrece una identificación más confiable que la identificación bioquímica convencional (un 37% más de identificaciones correctas a nivel de especie). En los casos en que hubo coincidencia en género y especie entre EM y secuenciación con scores entre 1,7 y 1,9, es recomendable repetir la EM utilizando el método de extracción. De acuerdo a los resultados de nuestro estudio y si bien los datos son insuficientes, los errores mayores se evidenciaron en los géneros Clostridium, Lactobacillus y Fusobacterium. La utilidad clínica de estos sistemas para la identificación de BA pasa por la optimización de las bases de datos disponibles y a medida que éstas se vayan completando, el desempeño mejorará.