Mapas de ligamiento Luis Barboza Centro para investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS) Universidad de Costa Rica Julio 2009
Posiciones de genes en cromosomas Griffiths et al Mapas de ligamiento genético Hibridación in situ de influorescencia (FISH) Map based cloning
Meiosis Griffiths et al. 2008
Mapas de ligamiento –No muy precisos debido a: Dobles recombinantes Interferencia –Funciones para corregir: Haldane Kosambi
Práctica Lineas recombinantes Arabidopsis thaliana Poblaciones inmortales
Broman et al. (2005) Población: RILs Ler×Cvi (Recombinant inbred lines) Parentales Híbrido F1 Descendencia por semilla única “Líneas Inmortales”
Ejercicio 1: CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) FR: (13/20)*100 = 65 cM Conclusión: GAPB A y GAPB B no se encuentran ligados FR > 50 cM P P P P P R R R R R R R R R R R P P R P P R Frecuencia de recombinación (FR):Núm. Recombinantes/ Total población a b a a a a a b b b b b a a b b a b a b a b a b a a a b b a a a a a b b a a a b b b a b
Chi-cuadrado Griffiths et al. 2008
Chi-cuadrado Hipótesis nula: No hay ligamiento (loci son segregados independientemente) Hipotesis alterna: Sí hay ligamiento Hipótesis nula es rechazada Posiblemente hay ligamiento Griffiths et al. 2008
Ejercicio 2: Longitud de inflorescencia Er - Er +
Ejercicio 3