Transcripción en eucariontes: tres RNA polimerasas nucleares (y un tipo de promotor para cada una…) RNA pol I: transcribe genes de rRNA RNA pol II: transcribe mRNA y algunos snRNA (small nuclear RNA) RNA pol III: transcribe tRNA, RNA 5S, algunos snRNA. 29 de marzo 2011

El promotor de RNA pol II Unión del factor de transcripción Sp1 unión de la RNA pol II y sus factores asociados. Unión de CTF o NF1 29 de marzo 2011

Orden de unión de factores es: Transcripción basal en eucariontes requiere de muchos factores proteicos asociados a la región del promotor. RNA pol II no es capaz de unirse al DNA por sí misma, requiere la unión previa de factores de transcripción basal. Orden de unión de factores es: TFIID (con TBP) TFIIA y TFIIB RNA pol II y TFIIF TFIIE y THIIH Uno de los factores tiene actividad histona acetil transferasa, para acetilar histonas y asi separarlas del DNA en los nucleosomas Complejo de preiniciación Esta diapo es compleja, Por TFII H (helicasa) TFIIF fosforila extremo CTD de la RNA pol II Durante la elongación todos los TF se sueltan de la RNA pol II, excepto THIIF. 29 de marzo 2011

Terminación de la transcripción en eucariontes Secuencia codificante 29 de marzo 2011

La estructura de la cromatina es un elemento crítico en la expresión de genes en eucariontes Genes activamente transcritos están en regiones de cromatina de baja condensación 29 de marzo 2011

Re-modelamiento local de la cromatina para la transcripción 29 de marzo 2011

29 de marzo 2011

Procesamiento del RNA en eucariontes 29 de marzo 2011

Adición de “cap” en el extremo 5’ del pre-mRNA (RNA capping) Ocurre en el núcleo, Comienza tan pronto como el extremo 5´está disponible (RNA < ~30 bases). Por lo tanto, el transcrito sufre el capping mientras aún está siendo sintetizado. Funciones: 1. Protección del RNA de la degradación 2. Señal para traducción 3. Transporte desde el núcleo al citoplasma 29 de marzo 2011

Poliadenilación del RNA Señal de poliadenilación 29 de marzo 2011

Poliadenilación del mRNA Dónde?: Núcleo Cuándo?: Se inicia antes de terminar la transcripción, antes de la eliminación de los intrones Para qué?: Exportación del mRNA desde el núcleo Estabilidad del mRNA en el citoplasma 29 de marzo 2011

RNA Splicing Remember, EXONS are EXpressed, INTRONS are the INTervening sequences 29 de marzo 2011

RNA splicing en eucariontes 29 de marzo 2011

Spliceosoma esta formado por SnRNP (small nuclear ribonucleoproteínas): SnRNPU1 Pr. + RNAU1 SnRNPU2 Pr. + RNAU2 SnRNPU3 Pr. + RNAU3 SnRNPU4 Pr. + RNAU4 SnRNPU5 Pr. + RNAU5 SnRNPU6 Pr. + RNAU6 Se degrada 29 de marzo 2011

Splicing por spliceosomas: Señales EXON INTRON Sitio dador del splicing Sitio aceptor del splicing Sitio de ramificación GUPuGU CUPuAPy Py rich NCAG 29 de marzo 2011

Mecanismo de splicing por spliceosomas 29 de marzo 2011

Splicing alternativo 29 de marzo 2011

Varios modos of splicing alternativo 29 de marzo 2011

Splicing alternativo en RNA del gen de la cadena pesada de IgM Ig secretada desde Ig de membrana (Linf B) Cels Plasmáticas 29 de marzo 2011

Control del splicing 29 de marzo 2011

Alteraciones del splicing: Beta-talasemias. Mutaciones en el gen de beta globina que alteran el splicing 29 de marzo 2011

Autosplicing intrones grupo II EL propio intrón hace la catálisis Mecanismo es muy parecido al de splicing de pre-mRNA nuclear, pero es independiente de spliceosomas. Intrones grupo II presentes en genes de mitocondrias y de cloroplastos 29 de marzo 2011

Autosplicing de intrones del grupo I Originalmente observados en núcleo de Tetrahymena (un protozoo ciliado), en el procesamiento de precursores de rRNA. Mecanismo es diferente al descrito para intrones nucleares y del grupo II. 29 de marzo 2011