GBIF present, futur i aplicacions Universitat de Barcelona, 14 de mayo 2009 Infraestructura Mundial d'Informació en Biodiversitat Francisco Pando GBIF.

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1 GBIF present, futur i aplicacions Universitat de Barcelona, 14 de mayo 2009 Infraestructura Mundial d'Informació en Biodiversitat Francisco Pando GBIF - España

2 Guión Información sobre Biodiversidad y sus retos GBIF como respuesta GBIF hasta ahora Por-venir de GBIF A modo de conclusión

3 En biología es posible hacer muchas preguntas sencillas que no sabemos responder Richard Feynman

4 ¿Por qué? La Biodiversidad tiene: complejidad intrínseca implicaciones múltiples, más allá de la ciencia dispersión de la información que solo se publican los resultados

5 Biodiversity linkages. Developed by Martin Sharman, EC Implicaciones múltiples

6 Dispersión de la información Un ejemplo: hongos de la Península Ibérica 46 bases de datos 16 países 45.000 registros con coordenadas http://data.gbif.org

7 Solo se publican los resultados HEYWOOD, V.H. (1974). Systematics-the stone of Sysyphus. Biol. J. Linn. Soc. 6(2): 169-178. © The Art of Steven Nelson

8 A instancias de la OCDE (1996, MegaScience Forum) Los miembros ordinarios de GBIF son estados Los estados miembros se comprometen a establecer un nodo nacional de GBIF que –entre otras cosas-- será portal de esta información, además contribuyen económicamente a la iniciativa Iniciativa GBIF Es una iniciativa internacional, a 10 años vista, para hacer accesible por Internet toda la información disponible sobre los organismos vivos conocidos a nivel mundial (se ha hablado de GBIF como el “proyecto genoma humano” de la biodiversidad)

9 Junio de 1999: el Consejo de Ministros de la OCDE acuerda crear GBIF Marzo del 2001: GBIF nace oficialmente 2002: La Secretaría Mundial del GBIF se instala en Copenhague 2003: Primer plan de trabajo anual de GBIF y primeras convocatorias de proyectos y contratos Cronología de GBIF

10 Contenido –Informatización de las colecciones de Historia Natural –Catálogo electrónico de nombres científicos –“Species bank”: bases de datos con información sobre especies (descripciones, claves, imágenes, …) –Biblioteca Virtual de la Biodiversidad Informática –Tecnología e interoperabilidad de bases de datos (estándares, infraestructura informática) Participación –Nodos nacionales –Centros y proyectos con información sobre biodiversidad –Convenios Internacionales –Formación Programas temáticos GBIF

11 El catálogo electrónico de nombres de organismos conocidos para la ciencia posibilita el enlace entre muchos tipos de bases de datos biológicas y no biológicas Contenidos y relaciones GBIF

12 No duplicar redes, proyectos, instituciones y servicios. Colaborar con los distintos actores para mejorar la eficacia global de los procesos científicos y de uso de datos sobre biodiversidad. Complementar, mediante la aportación aquellos elementos de los que se carece, para mejorar el acceso y la calidad de los datos de biodiversidad. Respetar el crédito de los datos. Esto es, los administradores y autores de las fuentes de datos retienen todo el control sobre su difusión y se fomenta que su uso sea debidamente acreditado. Promover y practicar una política de acceso libre a los datos y de desarrollos informáticos de código abierto. No competir por recursos con los centros y proyectos participantes en GBIF, y en concreto no participar en proyectos presentados a convocatorias competitivas. Ser neutrales en cuanto a la colaboración con los distintos entes participantes en GBIF. Los principios de GBIF

13 Museo Nacional de Ciencias Naturales Real Jardín Botánico Resolución del MCYT Consejo Superior de Investigaciones Científicas Nodo Nacional de GBIF Unidad de Coordinación Implementación GBIF en España

14 Estructura en red (U. coordinación + centros y proyectos) Unidad de Coordinación dentro de un centro Sin presupuesto para financiar proyectos implementación ANEP GBIF en España

15 Esta misión se plasma en las siguientes tareas: Proporcionar soporte técnico (información, formación, estándares, software y asesoramiento) Asegurar la coherencia entre las iniciativas nacionales y la arquitectura informática de GBIF, para garantizar la interoperabilidad Investigar como maximizar el valor de los datos, al desarrollar herramientas de análisis, validación y visualización de los mismos Recopilar y difundir información relevante para las colecciones y para el conocimiento y gestión de la información sobre biodiversidad Unidad de Coordinación Misión: apoyar a las colecciones, centros y proyectos relevantes sobre biodiversidad para que participen en GBIF GBIF en España

16 Digitalización (s.l.) de datos Publicación de datos de biodiversidad en Internet Base de datos de centros y proyectos (http://www.gbif.es/InformeColecciones.php)http://www.gbif.es/InformeColecciones.php Apoyo y seguimiento a proyectos y centros participantes Software de informatización y gestión de colecciones y proyectos y otras herramientas informáticas Portal de comunicación Portal de datos y servicio de alojamiento de datos Talleres de bioinformática Difusión y fomento de la participación Participación a nivel internacional (con TDWG, con el Secretariado de GBIF, con otros Nodos) Actividades GBIF en España

17 El sistema de información del nodo español del GBIF está formado por una Unidad de Coordinación y por una federación de bases de datos integrada por los Centros Participantes GBIF.ES = UC +CAR GBIF en España Acceso unificado Información distribuída  Los proveedores de datos retienen el control sobre los mismos

18 Heterogeneidad de la información vs. Acceso: estándarización Perfil com ú n: Las bases de datos de los centros – cada una con su propia estructura y sistema – se exportan a otra con el perfil de la red; una tabla con campos comunes que resultan accesibles de manera uniforme Est á ndares: www.tdwg.org

19 http://www.gbif.es/Participantes.php Biodiversidad: centros y proyectos

20 Datos Desde entidades españolas: 48 Instituciones 110 Bases de datos 3.887.246 Registros De todo el mundo: 285 entidades o instituciones 3000 Bases de datos 174.082.706 Registros 50 países, 40 organizaciones internacionales http://data.gbif.org http://www.gbif.es/datos

21 Información sobre los organismo: cuando, donde y que De toda la variedad de datos o elementos de información asociada a los ejemplares y las especies, hay tres que --por el papel que juegan para establecer o comprobar hipótesis sobre las realidades biológicas (tendencias, distribuciones, predicciones, etc.)– son relevantes: cuando se encontró el ejemplar (o se hizo la observación) donde estaba y que era (la especie a la se asigna).

22 S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S # S Cd. Obregón Tecomán, Col. Comarca Lagunera Planicie Huasteca Gossypium barbadense Fuente: Jorge Soberón Introducción de OGMs: Análisis de riesgos

23 Predicting the impact of climate change on biodiversity – a GEOSS scenario. Nativi et al. In “The Full Picture, A publication for the GEO Ministerial Summit, ‘Earth Observation for Sustainable Growth and Development’ Cape Town, 30 November 2007” Fuente: Registros y modelo de distribución de Vanessa atalanta b a 1900-19301960-1990 Cambio climático

24 Portales: http://data.gbif.org http://www.gbif.es/datos Acceso unificado, datos distribuidos

25 Donde estamos ahora Consolidación Por venir, pinceladas técnológicas: Incorporación otros tipos de información Integración con otras fuentes de datos Integración con otras aplicaciones informáticas Indexado de información

26 PliC: esquema de intercambio para información de especies www.pliniancore.org

27 Incorporar otros tipos de información http://ara.inbio.ac.cr http://especies.gbif.es Especies

28 Integración con otras aplicaciones informáticas http://data.gbif.org/tutorial/services http://data.gbif.org/ws/rest/oc currence/list?scientificname= Echinostelium+apitectum&fo rmat=darwin GBIF & web services

29 Integración con otras fuentes de datos “Widget” WCMC-GBIF: Combina información de polígonos (áreas protegidas) con datos de puntos (GBIF)

30 Indexado de información

31 Por venir Internacional Regionalización Puesta al día de la arquitectura de datos y la tecnología Evaluación de GBIF En España Conectar gestión y ciencia Imágenes Herramientas informáticas y formación

32 Para concuír (y discutir) GBIF plantea una manera nueva de hacer las cosas Participación plural (datos distribuidos) Acceso unificado Cambio de cultura científica y de gestión Reconocimiento (publicar datos en línea como mérito científico ) Formación (en bioinformática) Citación (como práctica) Producir datos y gestionar datos ¿Dónde está el equilibrio?

33 50 países, 40 organizaciones internacionales 171.000.00 registros, 1710 bases de datos En España: 43 Instituciones, 110 Bases de datos 3.817.963 Registros de biodiversidad GBIF-ES es el Nodo Nacional de Información sobre Biodiversidad patrocinado por el Ministerio de Ciencia e Innovación y gestionado por el Consejo Superior de Investigaciones CientíficasConsejo Superior de Investigaciones Científicas El Real Jardín Botánico es la sede la Unidad de Coordinación de GBIF en España W W W. G B I F. ES GBIF en resumen  Acceso unificado a la información en biodiversidad  Participación plural  Integración de los resultados de la investigación en biodiversidad en la gestión de recursos y territorio  Formación en bioinformática  Conexión ciencia - sociedad