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Publicada porGael Bras Modificado hace 10 años
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Nuevas necesidades de comunicaciones en el ámbito de la imagen médica para el desarrollo de un motor de búsqueda con fines de investigación Oihana Belar 1, Sergio Bartolomé 2, Josu Aramberri 3 Roberto Bilbao 1 1 Biobanco Vasco, Bilbao, 2 Redytel, Erandio, 3 I2BASQUE Donostia-San Sebastián
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BIOPOOL: un proyecto de servicios de imagen médica BIG DATABiobancosComunicaciones Almacenamiento de datos: Nube
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Donantes sanos Pacientes Datos Procesamiento muestras Research center Muestras y datos Biobancos Sociedad Funcionamiento de los biobancos DATOS MUESTRAS
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Biobank 2 Biobank n Biobank 3 Biobank 1 Many queries based on diagnosis for each biobank 40 colon adenocarcinoma 1.SITUATION BEFORE THE BIOPOOL PROJECT Issues to be solved Data dispersion Different languages Different data set format TEXT DATA SET Less usage of data Less accessibility Many queries to find a specific sample or enough number of samples
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1.Biobanks are misused National Bioethics Advisory Commission estimated that there were 282 million specimens in the US
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2.IDEA: DEVELOPMENT OF DIGITAL BASE DATA Tumor surgically removed Lung tumor processed to histological slide Lung with tumor Digital scanning of histological sections Central server of Biobank Histological images Associated Clinical data Tumor Imagen
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Datos morfológicos Datos diagnóstico AP Datos
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2.IDEA: DEVELOPMENT OF DIGITAL BASE DATA Biobank 3 Biobank 4 Biobank n Biobank 1 Biobank 2 Tumor surgically removed Lung tumor processed to histological slide Lung with tumor Digital scanning of histological sections Central server of Biobank Histological images Associated Clinical data Búsquedas basadas en texto y/o imágenes
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Red de biobancos y hospitales Investigador BIOPOOL: Web 3.0 interface Servicios BIOPOOL Docente Médico
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Application to the call: FP7 ICT 2011.4.1 SME initiative on digital content and languages
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7 partners 1 non-profit public body. 2 Research Centres 3 SMEs1 University From 4 different countries 3. THE COMPOSITION OF THE CONSORTIUM
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Buscador de muestras BIOPOOL RESULTADO OBTENIDOS
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www.biopoolproject.eu
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BIOPOOL prototype
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Search engine result
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Problemas a resolver Almacenamiento de datos Comunicaciones: envío de datos
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Problemas de comunicaciones y almacenamiento 2000-3000 imágenes/año 0.5-10 GB/imágen Diferentes formatos de almacenamiento Diferentes tipos de fichero
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Almacenamiento de imágenes: Nube privada Biobanco Vasco Edificio central del Sistema sanitario Proveedor de servicios de nube privada: almacenamiento de imágenes
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Nube Biobanco
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Recomendaciones de AEPD I La jurisdicción aplicable es la española El cliente tiene que dar su conformidad a la participación de terceras empresas, al menos delimitando genéricamente los servicios en los que participarán A la terminación del contrato, a entregar toda la información al cliente en el formato que se acuerde. El cliente debe tener la opción de exigir la portabilidad de la información a sus propios sistemas de información o a un nuevo prestador de cloud cuando considere inadecuada la intervención de algún subcontratista o la transferencia de datos a países que estime no aportan garantías adecuadas. Deben preverse mecanismos que garanticen el borrado seguro de los datos cuando lo solicite el cliente y, en todo caso, al finalizar el contrato
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Flujo de datos en el proyecto BIOPOOL
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Cumplimiento de la normativa legal
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GRACIAS Eskerrik asko
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