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Uso actual de SNOMED-CT en los Servicios de Anatomía Patológica Coordinador de Sistemas de Información Hospital.

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Presentación del tema: "Uso actual de SNOMED-CT en los Servicios de Anatomía Patológica Coordinador de Sistemas de Información Hospital."— Transcripción de la presentación:

1 Uso actual de SNOMED-CT en los Servicios de Anatomía Patológica Coordinador de Sistemas de Información Hospital General de Ciudad Real Servicio de Salud de Castilla-La Mancha (SESCAM) Junta Directiva de la SEIS en España y Europa en España y Europa Marcial García Rojo

2 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 2 Objetivos de la presentación 1. Contexto actual: Estándares SI en Patología 2. Introducción a SNOMED: Evolución de codificación a terminología clínica 3. Principios básicos de SNOMED: Contenido y estructura. Ejemplos 4. SNOMED y Europa: Del NHS del Reino Unido, a la International Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO). 5. SNOMED en España 6. Mantenimiento y mejora del contenido 7. Subconjuntos, referencias cruzadas (mapeos)

3 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 3 Interoperability in the Hospital

4 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha Situación actual Mambrino / Mambrino XXI Laboratorio (SigloWeb) Cartelería digital

5 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 5 Interoperabilidad: Hay estándares para Anatomía Patológica? Aún no se ha conseguido integración en los sistemas de información implicados en Anatomía Patológica. Los esfuerzos de estandarización se los sistemas de información (proyecto Serendipia) se basan en: CEN TC 251 (pr EN13606): Historia Clínica Electrónica HL7: Mensajes entre aplicaciones informáticas DICOM: imagen médica IHE iniciativa (http://www.ihe.net/): Cómo utilizar estándares.http://www.ihe.net/ Noticia reciente: Se ha publicado para fase de implementación el Marco Técnico para Patología que identifica los flujos de trabajo, los actores (unidades funcionales y roles, p.ej: El S.I. de Anatomía Patológica es un actor) y las transacciones entre ellos.

6 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 6 Necesidad de interoperabilidad de contenidos Ámbito europeo: iniciativa i2010: Espacio Europeo de la Información, Innovación y Servicios Públicos (eHealth) Ámbito nacional: Historia Clínica del SNS. Plan Avanza (Red.es: Sanidad en línea) Intercambiar informes de Anatomía Patológica entre diferentes hospitales Consensuar tipos de muestras, diagnósticos Uso científico eficiente de registros de tumores Elaborar guías o procedimientos normalizados a nivel regional o nacional Búsquedas de información (entre hospitales)

7 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 7 Flujo de trabajo: IHE

8 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 8 Normalización de términos Specimen is the physical object that is subjected to technical process(es) and/or imaging procedure(s) which results in an image(s). Part: removed during a harvesting or surgical procedure (usually put in a Box) Tissue dice(s) created after a fixation process (embedded in a Block, contained in a Cassette) A Tissue item (section or smear) (on a Slide).

9 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 9 IHE. Actores y Transacciones

10 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 10 HL7: Lenguaje para máquinas Mensaje entre aplicaciones: MSH|^~\&|APA|||| ||ORM^O01| |R|2.3|PID||1|1||MOD_NOMB^MOD_APE1^MOD_APE2|| |F| ||^^^^||||||||||||||||||||PV1|||^|||^|||||||||||||0|||||||||||||||||||||||||||ORC|XO|- 1|05B ||CM|||||||||||| MSH|^~\&|APA|||| ||ORU^R01| |R|2.3|PID||1|1||MOD_NOMB^MOD_APE1^MOD_APE2|| |F|||^^^^||||||||||||||||||||PV1|||^|||^|||||||||||||0|||||||||||||||||||||||||||ORC|XO |-1|05C ||CM|||||0^DESCONOCIDO||10009^GOMEZ, ALICIA|||||OBR|1|- 1|05C |^^^^||| ||0|^^^|F||| |^^^^^|10009^ GOMEZ, ALICIA^^|||GI^GINECOLOGIA||| |||F||0^^^^^^^^^|||||10002^GARCI A^F.^H.^^|||| |0||^^^^|OBX|1||73^MUESTRA^L^A^|0|CERVIX CT1|^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|2||^MATERIAL REMITIDO^L^^|1|CITOLOGIAS/ RASPAT CV/ A) CERVIX CT1|^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|3||^DATOS CLINICOS^L^^|2||^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|4||^MACRO^L^^|2||^^^^|| |0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|5||^MICRO^L^^|2|A ) celulas vaginales normales|^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|6||^MICRO^L^^|3| |^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|7||^DIAGNOSTICO^L^^|4|A ) CITOLOGIA NORMAL|^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|8||^DIAGNOSTICO^L^^|5| |^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|9||T83000^SNOMED^L^^|6|CERVIX|^^^^|||0 ||||||^^^^|^^^|^^^^|OBX|10||M00120^SNOMED^L^^|7|CITOLOGIA NORMAL|^^^^|||0||||||^^^^|^^^|^^^^|

11 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 11 Intercambio de información

12 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 12 Evolución de SNOMED-CT SNOMED nació como un sistema de codificación, es decir, asignar un código (SNOP, 1965). Aún utilizado en su versión SNOMED II (1979) y 3.0 (1993). En 2000 pasó a ser una terminología clínica de referencia: SNOMED Reference Terminology (SNOMED RT) En 2002, acuerdo con Reino Unido SNOMED Clinical Terms (SNOMED CT). Es año, nace la versión en Español. LOINC (laboratorios) y NDF-RT son vocabularios controlados. Terminología clínica: Diseñada para registrar datos clínicos en historia clínica electrónica. Orientada a registrar aspectos relevantes de la atención médica en forma normalizada. SNOMED se considera una terminología de referencia (incluye relaciones entre los conceptos que definen su significado) y una terminología de interfase. Nomenclatura Sistematizada de Patología Medicina

13 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 13 Terminología de interfase Facilita el ingreso de datos utilizando términos familiares para el usuario Facilita la búsqueda eficiente de conceptos Búsqueda de texto Navegación de conceptos Posibilidad de agregar calificadores Permite representar los conceptos utilizando los términos preferidos por el usuario Permite entender el significado del concepto al proveer una descripción completa (FullySpecifiedName) Permite filtrar los conceptos en base al contexto de la aplicación, mediante el mecanismo de definición de subconjuntos de la terminología

14 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 14 Terminología de Referencia

15 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 15 Ventajas de SNOMED CT Amplitud del contenido Compatibilidad con versiones previas Adaptabilidad para su uso en diferentes escenarios Desarrollo basado en las necesidades e implementaciones de los usuarios Posibilidad de pre y post coordinación Extendible Posibilidad de mapeos Posibilidad de definición de subconjuntos Múltiples lenguajes y dialectos

16 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 16 Escasa implantación SNOMED CT Es poco frecuente ver sistemas de información con una integración de SNOMED CT. Podría ser debido a: Desconocimiento sobre sus beneficios o Desconocimiento en la forma de integrar SNOMED Problemas con la conversión de sistemas anteriores Los usuarios creen que SNOMED puede que no cubra sus necesidades Dificultades para la representación de conocimiento de determinados dominios

17 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 17 Contenidos de SNOMED CT Hallazgos/conclusiones/evaluaciones trastornos Hallazgos clínicos (por lugar, método, función) Procedimientos planes, intervenciones, tratamientos, prescripciones, cirugías Estructuras anatómicas Estructuras normales (anatomía/ topografía) Estructuras anormales (patología/ morfología) Función (incluso habilidades y propiedades) Organismos Vivos Sustancias (drogas, productos químicos, productos biológicos) Agentes físicos, fuerzas y actividades (causas de lesión) Ocupaciones Contexto social y demográfico (raza, grupo étnico, religión, estado civil, nivel de la educación, hábitos, relaciones familiares, etc.) General (contexto, modificadores, localización, certeza, severidad, curso, períodos de tiempo, estadificación, estado, características) Otro (especímenes, relaciones espaciales, unidades) January ,000 Concepts 794,000 Descriptions 920,000 Relationships January ,000 Concepts 794,000 Descriptions 920,000 Relationships

18 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 18 Content Summary: January 2008

19 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 19 Hallazgos clínicos También pueden llamarse observaciones Incluye signos, síntomas, trastornos, enfermedades, resultados de laboratorio, observaciones de imágenes, etc. – Ejemplos: Dolor Descenso del sodio sérico Capaz de caminar

20 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 20 Trastornos Incluye enfermedades, o alteraciones que puedan ser listadas como diagnósticos. Desde enero de 2005 son considerados hallazgos, pues suele haber superposición. – Ejemplos: Leucemia aguda promielocítica Gingivitis aguda ulcerativa y necrotizante

21 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 21 Diagnósticos

22 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 22 Entidades observables Incluye entidades que son el sujeto de una observación Una vez realizada la observación – Hallazgo= observable + valor Ejemplos Frecuencia cardiaca Temperatura Viscosidad del líquido sinovial

23 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 23 Procedimientos Incluye acciones en el contexto de la administración, tratamiento y provisión de cuidados de la salud Incluye intervenciones quirúrgicas y procedimientos diagnósticos Ejemplos Examen físico Cambio de vendaje Apendicectomía Rehabilitación poslaringectomía

24 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 24 Ejemplos: procedimientos

25 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 25 Ejemplos: Procedimientos

26 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 26 Anatomía y morfología Estructuras anatómicas – Hígado Estructura del hígado Hígado como un todo Estructuras anormales – Anomalías morfológicas Quiste Neoplasia Fractura

27 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 27 Organismos Bacterias, hongos, parásitos Animales, plantas Criterio de inclusión – De interés para la medicina humana y veterinaria

28 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 28 Sustancias y productos farmacéuticos Separados en dos jerarquías Substancias Ingredientes genéricos Productos Drogas clínicas * Nombre, potencia, forma farmacéutica

29 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 29 Uso de SNOMED: Tinciones

30 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 30 Cómo se organizan los conceptos Trastorno = Sitio del hallazgo + Morfología asociada Carcinoma papilar de tiroides Sitio del hallazgo: Estructura de la glándula tiroides Morfología asociada: Adenocarcinoma papilar

31 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 31 Sinónimos

32 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 32 Relaciones ente términos

33 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 33 Estadificaciones

34 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 34

35 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 35 El Identificador de concepto

36 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 36 Las tablas principales

37 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 37 Sinónimos

38 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 38 Licencias de SNOMED En abril de 2007 la gestión de SNOMED CT fue transferida a la Organización para el Desarrollo de Estándares Internacionales de Terminología de Salud / International Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO) IHTSDO asume la responsabilidad de: mantenimiento, desarrollo, garantía de calidad y distribución El Colegio Americano de Patólogos (CAP) da apoyo inicial a IHTSDO durante 3 años y de forma separada ofrece productos y servicios relacionados con SNOMED, como consultoría, o formación. Cada país que participa en IHTSDO tiene su propia entidad gestora: En Reino Unido antes NHS ahora UK Terminology Centre (UKTC), con las funciones de: Oficina de gestión, distribución, soporte y control del uso de SNOMED-CT y productos relacionados

39 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 39 Qué incluye SNOMED-CT –Las tablas de los conceptos, descripciones y relaciones –Referencias cruzadas a CIE-9-MC -con fines epidemiológicos y/o estadísticos. –Guía de Referencia Técnica de SNOMED CT. –Un browser que permite navegar la terminología. –2 actualizaciones: abril y octubre (Ed. Español) o enero y julio (Ed. Inglés EEUU)

40 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 40 SNOMED CT en Europa International Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO), con sede en Dinamarca SNOMED CT es un producto propiedad intelectual registrada por el IHTSDO 9 países son miembros del IHTSDO 5 de 9 miembros son países europeos: Dinamarca Lituania Los Países Bajos Reino Unido Suecia

41 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 41 SNOMED CT en Europa 5 países europeos tienen derechos nacionales para el uso de SNOMED CT 23 organizaciones dentro de Europa tienen licencias Unas organizaciones: Hospital Geral Santo Antonio (Portugal) C2C Consultoria TSIS (España) Hospital de Fuenlabrada (España) Hospital General de Ciudad Real (España) Sociedad Española de Informatica y Salud (SEIS) (un acuerdo de colaboración con SNOMED Terminology Solutions)

42 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 42 SNOMED en Europa Qué recibe el Servicio de Salud Británico (NHS) de SNOMED Productos/Servicios El núcleo de SNOMED CT (inglés británico), mapeos (ICD-10 y OPCS-4), documentación Aplicacion(es) Mercado(s) Hospitales, clínicos y otros lugares de atención dentro del NHS Cómo entrega los productos/servicios al mercado A través del NHS y SNOMED (ahora IHTSDO) Mantenimiento Actualizaciones: enero, julio

43 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 43 SNOMED en Europa

44 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 44 European COST Action IC0604 Scientific programme Automation procedures in Pathology. Best technology available and under research. Scanning solutions for Pathology microscopic slides. Technological solutions for compression and storage problems with large image files. Virtual slide standard viewer specifications which allow efficient reviewing of pathology images. International standards (DICOM, HL7, SNOMED, CEN) and IHE initiative. Model for pathology and other hospital information systems An European-scope telepathology network Collection of interesting and typical samples, and clinico-pathological sessions

45 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 45 EURO-TELEPATH Current research groups Action kick-off Finland: Tampere University & University of Helsinki France: INSERM & Tribvn Germany: University of Regensburg & Charité Universitätsmedizin Berlin Italy: University of Udine Lithuania: National Centre of Pathology & Kaunas University of Technology Poland: Institute of Tuberculosis and Lung Diseases, Warsaw Portugal: Hospital Espirito Santo Serbia: University of Belgrade Spain: University of Castilla-La Mancha, Hospital General de Ciudad Real & SESCAM Switzerland: EPF Lausanne United Kingdom: University of Nottingham

46 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 46 SNOMED en España Edición en español: Actualización de julio de 2007 (basada en la edición en inglés de enero de 2007) Conceptos activos: Más de Descripciones: Más de Relaciones: Más de Usuarios: Institut Catalá dOncologia Servicio Gallego de Salud Consellería de Sanidad de la Generalitat Valenciana SESCAM Balidea WebSanitaria…

47 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha componentes esenciales en patología digital 1.Sistema de información de Anatomía Patológica (SIAP) 2.Gestión de imágenes 3.Automatización de laboratorio 4.Identificación de objetos 5.Estaciones de trabajo específicas 6.Entrada de datos (interfaz de usuario) 7.Visualización de imágenes y datos 8.Herramientas de comunicación 9.Búsqueda de información 10.Gestión del conocimiento

48 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 48 Telepatología HOSPITAL A HOSPITAL B RemitenteSegunda opinión

49 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 49 SESCAM Diseño de integración

50 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 50 Aurora Viewer

51 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 51 Identificación portas: Tinciones Documents Containers Cassettes Slides Bar code Direct print: Leica/Sakura (2D: datamatrix) Label (resistant) with bar code: Radiofrequency (RFID): tissue blocks and slides

52 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 52

53 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 53

54 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 54

55 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 55 Mantenimiento y mejora del contenido Actualizaciones (2 /año) Aportación de nuevas entidades (¿Desde España?)

56 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 56 SNOMED CT en Patología 91 licencias por el mundo para el uso de SNOMED CT en patología Incluye vendedores de sistemas informáticos para el laboratorio Incluye el Centers for Disease Control and Prevention (EEUU) para los checklists de cáncer Incluye licencias para el uso del subconjunto de patología, los checklists de cáncer y las versiones previas de SNOMED que tiene un énfasis en patología La mayoría de las organizaciones con licencias son hospitales dentro de los EEUU

57 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 57 Subconjunto Anatomía Patológica Incluye más de conceptos relacionados con anatomía patológica que forman parte de SNOMED CT. Corresponde a una extensión del antiguo Surgical Pathology Microglossary Contribución esencial del CAP Principal expansión: Cancer checklists (protocolos) Colaboración con ICD-O para morfología (M- codes) y topográficos (T-codes)

58 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 58 Subconjuntos: Patología

59 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 59 SNOMED en NHS

60 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 60 Referencias cruzadas Referencias cruzadas [CIE-03; LOINC®; CIE-9; CIE-10 (edición británica); OPCS-4 (edición británica); NIC; NOC; NANDA; PNDS; HHCC; The Omaha System] Vocabularios: Enfermería, lab LOINC, SNODENT Clasificaciones y agrupaciones: ICD-9CM, ICD-10, ICD- O, PNDS)

61 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 61 Standardized Terminologies Integrated within SNOMED CT SNOMED CT ICD-9 and ICD-10 (UK) LOINC PNDS CCC NANDA NIC Omaha System NOC ICNP CPT

62 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 62 Conclusiones España tiene previsto participar en IHTSDO Las empresas españolas de S.I. de Patología tienen poca experiencia en la integración de SNOMED (más allá de codificación). En SESCAM: Patwin (iSoft) Novopath Web (Vitro) Principales problemas: Códigos locales ¿Migrar histórico SNOMED II a SNOMED CT?

63 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 63 Conclusiones. Aplicaciones de SNOMED Historia clínica electrónica Informes de laboratorio Almacenamiento de imágenes Informes de anatomía patológica – protocolos Base de datos para las autopsias Sistema de apoyo para la toma de decisiones Codificación de la noticia sobre la salud en la prensa Banco de tejidos

64 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 64 Enlaces de interés IHTSDO: CAP (SNOMED Terminology Solutions): NHS: /systemsandservices/data/snomed /systemsandservices/data/snomed

65 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 65 Agradecimientos Guillermo Reynoso, MD Joe Schramm, MA

66 Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 66 9th European Congress on Telepathology http ://www.seapcongresos.com/telepathology2008/


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