Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Presentación del tema: "Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)"— Transcripción de la presentación:

1 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Nomenclatura. Reactividad del esqueleto. Desnaturalización. Daño y reparación. Enzimología básica de Acidos Nucleicos. Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos.

2 Acidos Nucléicos (estructuras)
Papel moderno de DNA y RNA. Fuerzas que intervienen. Flexibilidad y polimorfismo del DNA. Topología. Acidos Nucléicos y Genomas.

3 Bioquímica y Biofísica
Acidos Nucleicos Bioquímica y Biofísica

4 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Nomenclatura. Notación. Tipos de bases. RNA vs. DNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

5 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Tautomería Bases Raras Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

6 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Reactividad del esqueleto. H+, OH- (RNA vs. DNA). Fragilidad mecánica y sus implicaciones. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

7 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Reactividad del esqueleto. Despurinación. Metilación. Desaminación. Implicaciones de sustitución en anillo en la reactividad del esqueleto. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

8 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Desnaturalización. Tm (Composición de bases, efecto de sal). Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

9 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Desnaturalización. UV. Hipercromicidad Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

10 Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
Hibridación. Fenómeno notable. Utilización. PNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

11 Hibridación multiple en chips
Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

12 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos. Síntesis: Problema básico resuelto (fase sólida, grupos protectores, automatización. Dinámica de la síntesis comercial). DNA vs. RNA. Secuenciación: Métodos originales. Método actual. Métodos futuros. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

13 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Síntesis Química de DNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

14 Secuenciación Enzimática
Estado del arte: electroforesis capilar Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

15 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Desarrollos futuros Degradación enzimática (procesiva) de moleculas individuales. Depende de la detección de una sola molécula Detección electroquímica (canales en membranas) del paso de una sola molécula. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

16 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Daño y reparación. Enzimología importante. Motor de la evolución. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

17 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Enzimología básica de Acidos Nucleicos. Nucleasas (inespecíficas, restricción, dependientes de estructura o estado). Nick. Gap. Fosfatasas, cinasas. Ligasas Metilasas. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

18 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Papel moderno de DNA y RNA. (Papel primitivo. ¿Por qué la pregunta?) Estructura clásica del DNA. (¿Cómo sabemos que es así? Watson y Crick fué un modelo satisfactorio.) Medidas. Complementaria. Antiparalela. Implicaciones de la estructura propuesta. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

19 Libertad Conformacional
Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

20 Estructura de Acidos Nucléicos: Fuerzas que intervienen.
(¿Serán las mismas que en proteínas?). Hidrofobicidad y apilamiento (stacking). Puentes de hidrógeno (complementaridad estérica y dirección). Implicaciones que perfilan estructuras alternativas. Fuerzas electrostáticas. Realmente desestabilizan. (Pensar consecuencias) Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

21 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Stacking Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

22 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Apareamiento de Bases Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

23 Flexibilidad y polimorfismo del DNA.
DNA A. DNA Z. DNA H. Bending y kinking. Polimorfismo e interacción proteína-DNA. (Contenido informacional de los surcos). Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

24 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
DNA A DNA B Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

25 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
DNA B DNA A Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

26 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
DNA Z Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

27 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Telómeros Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

28 Interacción Proteína-DNA
Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

29 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Topología. Loops. Cruciformes. Lineal vs. circular (círculos efectivos). Superenrrollamiento. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

30 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

31 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

32 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Superenrrollamiento Al disminuir L, se facilitan los procesos de replicación y transcripción. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

33 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

34 Estructura de RNAs (tRNA y rRNA)

35 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
RNA de transferencia Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

36 Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)
RNA ribosomal Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

37 Acidos Nucléicos y Genomas
Diversidad de tipos y tamaños. Avance sostenido de la ciencia genómica Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)