Consola Script. Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar Luego de escribir NewVar se oprime la tecla ENTER.

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1 Consola Script

2 Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar Luego de escribir NewVar se oprime la tecla ENTER

3 Entre comillas “ “ Significa que el valor de CharVar es justamente “Gene1”

4 tabla de datos númerica carácter

5 Este ejemplo interprételo de la siguiente manera: hay 8 individuos (una muestra), y en un determinado sitio del genoma se “midió” el par de bases de nucleótidos Esta función summary( ) realiza el cálculo de las frecuencias para cada nivel.

6 Como podemos observar, la entrada de la función matrix ( ) es un vector conteniendo los elementos de la matriz, empezando por la esquina izquierda para formar la primera columna de ocho filas, y luego empezando nuevamente otra vez desde arriba para completar la segunda columna. El número de filas está especificado por la instrucción nrow = 8

7 Se ha formado la misma matriz “uniendo” los vectores columnas x1 y x2. Indica que es efectivamente una matriz de caracteres Indica que la entrada (1, 2), primera fila y segunda columna, es el par “GC” recalcando que se encuentra en la segunda columna llamada x2 Indica que la matriz X es esencialmente un vector de longitud 16, y conserva las posiciones donde los primeros 8 elementos corresponden a la primera columna y los 8 restantes a la segunda columna

8 Esta función entrega las dimensiones de la matriz y los nombre de filas y columna. En este caso no tienen nombre las filas de esta matriz y sí para las columnas. Cada atributo puede imprimirse separadamente, por ejemplo

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10 Una gran tabla de datos en el Internet

11 Indica que en la primera fila del archivo de texto está el nombre de la variable Indica que en la primera fila del archivo de texto son datos Indica que los datos están delimitados por por tabulación (tab) Indica que los datos están separados por columnas Indica que los datos están separados por uno o más espacios Sitio donde se encuentra el archivo llamado FMS_data.txt en el Internet Renombramiento y configuración de los datos para su lectura

12 En el script En la consola del R single-nucleotide polymorphisms La función que construye una tabla de datos

13 Observemos que podemos “aislar” los datos por columna con la instrucción $ seguido del nombre de la columna Bajo contexto, trabajando con esa tabla de datos y para citar a la columna “rapiodamente, usamos la instrucción … luego llamamos a las diferentes columnas de la tabla mediante su nombre

14 Recuerde que está “adjuntado” la tabla Datamuestra, y por eso utilizamos solo los nombres de las columnas Observe las diferentes maneras de obtener el porcentaje del género

15 Observe el paso de codificación de caracteres a codificación numérica, en este caso 1 = mujer y 0 = hombre Esta instrucción considera la segunda y cuarta columna Esta instrucción “condiciona” solo los valores para el género mujer Esta instrucción considera solo la tercera fila Esta instrucción considera solo la cuarta columna