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GBIF Y otras iniciativas internacionales
Universidad de Alicante Alicante, 14 noviembre 2007 GBIF Imágenes cedidas por el Secretariado Internacional de GBIF ( y del repositorio de imágenes libres stock.xchng ( El contenido de esta presentación está sujeto a una licencia de Creative Commons, tal y como queda establecido en la página: Y otras iniciativas internacionales de información sobre biodiversidad Alberto González Talaván Unidad de Coordinación de GBIF España
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Esquema de la charla Índice 1.- La información sobre biodiversidad.
Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. 1/42
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Información sobre biodiversidad Esquema de la charla Índice
1.- La información sobre biodiversidad. Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. Información sobre biodiversidad 1/42
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¿A qué nos referimos? Información sobre biodiversidad
A una basta cantidad de información, que podemos clasificar según distintos criterios. En paralelo a los distintos conceptos que existen sobre la diversidad biológica, tenemos: Pero tenemos mucha información asociada: Metodología empleada Criterios científicos Autoría Instituciones Nomenclatura y taxonomía Bibliografía científica Datos geográficos etc. Bioquímica Genética Celular Tisular Órganos Fotografía de cromatografía obtenida de Wikimedia Commons ( 2007/11/10, autor: Mnolf) Fotografía de árbol taxonómico obtenida de wikimedia commons: ( 2007/11/10, autor: Jeffdelonge) Organismos Poblaciones Interacción entre especies Hábitat Ecosistemas 2/42
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Fuentes Información sobre biodiversidad
Sin embargo, las dificultades comienzan ya a la hora de evaluar qué sabemos, ya que la información se genera y almacena de modo disperso en proyectos, colecciones biológicas y centros de investigación, sin un punto donde podamos obtener toda la información que existe sobre una especie -o conjunto de especies- para un ámbito determinado (geográfico, de hábitat, temporal,…) Colecciones biológicas: entre y millones de especímenes estimados en colecciones de todo el mundo (Duckworth et al. 1993, OECD 1999). Imagen: Silvia Lusa. Proyectos de investigación, inventarios y censos, centros de investigación, universidades, etc.: aún por evaluar, con el problema añadido de que se suelen publicar los resultados, y no los datos generados y recopilados para llegar a los mismos. 3/42
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Las colecciones biológicas
Información sobre biodiversidad Las colecciones biológicas Las colecciones biológicas tienen un papel muy importante que jugar cuando hablamos de información sobre biodiversidad, puesto que más allá de su valor como referencias taxonómicas, los propios especímenes albergan una información única con una potencialidad de uso aún por descubrir. En la explotación de esa potencialidad está su futuro. El valor de los especímenes va más allá de representar un testigo físico que posibilita la reidentificación y comprobación posterior de una cita. El valor de la información reside en su uso. El valor de un especimen con la información geográfica y temporal asociada a éste, puede sobrepasar con mucho el valor taxonómico que motivó su colecta y conservación: análisis de series temporales, diversidad genética, migraciones, etc. 4/42
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Posibles usos Información sobre biodiversidad
Taxonomía, nomenclatura, elaboración de floras y faunas, divulgación, formación de (para)taxónomos, etc. Biogeografía: atlas, modelización de nichos ecológicos, predicción de distribución futura. Dinámicas poblacionales: diversidad, riqueza, densidad, relación entre organismos. Fenología: ciclos vitales. Organismos amanazados, migratorios e invasores. Cambio climático. Ecología, evolución y genética. Conservación y planificación: selección de zonas de conservación, conservación ex-situ. Agricultura, gestión forestal, pesca y minería: variedades silvestres, plagas, patógenos, efectos de la contaminación, etc. Salud pública: enfermedades, vectores, parasitología. Bioprospeción: nuevos productos. Control de comercio de especies. Educación: universitaria, secundaria… Ecoturismo. Etnobiología, Historia de la ciencia, arte, planificación civil,… 5/42 Basado en Chapman, A. D Uses of Primary Species-Occurrence Data. Report for the GBIF, Copenhagen.
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Diapositiva original: M. Sharman
Información sobre biodiversidad Posibles usos Diapositiva original: M. Sharman. 6/42 Diapositiva original: M. Sharman
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Esquema de la charla Índice 1.- La información sobre biodiversidad.
Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. 7/42
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Acceso libre Esquema de la charla Índice
1.- La información sobre biodiversidad. Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. Acceso libre 7/42
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USA National Research Council
1997 Acceso libre “The value of data lies in their use. Full and open access to scientific data should be adopted as the international norm for the exchange of scientific data derived from publicly funded research.” Basado en una presentación de L. Speers “Bits of Power: Issues in Global Access to Scientific Data” USA National Research Council 8/42 Basado en una presentación de L. Speers
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2004 (1) Acceso libre Final Communiqué:
“Recognising that an optimum international exchange of data, information and knowledge contributes decisively to the advancement of scientific research and innovation” “Recognising that open access to, and unrestricted use of, data promotes scientific progress and facilitates the training of researchers” “Recognising that open access will maximise the value derived from public investments in data collection efforts” … “Ciencia, Tecnología e Innovación para el siglo XXI” Reunión del comité de la OCDE para Política Científica y Tecnológica a nivel Ministerial. 9/42
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2004 (2) Acceso libre DECLARE THEIR COMMITMENT TO: “Work towards the establishment of access regimes for digital research data from public funding in accordance with the following objectives and principles: Openness: balancing the interests of open access to data to increase the quality and efficiency of research and innovation with the need for restriction of access in some instances to protect social, scientific and economic interests.“ INVITE THE OECD: “To develop a set of OECD guidelines based on commonly agreed principles to facilitate optimal cost-effective access to digital research data from public funding, to be endorsed by the OECD Council at a later stage.” “Ciencia, Tecnología e Innovación para el siglo XXI” Reunión del comité de la OCDE para Política Científica y Tecnológica a nivel Ministerial. 10/42
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2006 Acceso libre 11/42
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2006 Acceso libre “Invites Parties and other Governments, as appropriate, to provide free and open access to all past, present and future public-good research results, assessments, maps and databases on biodiversity, in accordance with national and international legislation” Decisión del Convenio sobre Diversidad Biológica, en la Conferencia de las Partes VIII/11 en Cooperación Científica y Técnica y el Mecanismo de Facilitación. 12/42
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2006 Acceso libre “Stresses the attractiveness of policies mandating the public availability of research results – in open access repositories – reasonably soon (ideally, 6 months, and in any case no later than 12 months) after publication.” “The ERC Scientific Council hopes that research funders across Europe will join forces in establishing common open-access rules and in building European open access repositories that will help make these rules operational”. “Declaración sobre el acceso libre” Comité Científico del Consejo Europeo de Investigación 13/42
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Esquema de la charla Índice 1.- La información sobre biodiversidad.
Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. 14/42
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Iniciativas internacionales Esquema de la charla Índice
1.- La información sobre biodiversidad. Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. Iniciativas internacionales 14/42
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Nomenclatura y taxonomía
Iniciativas internacionales Nomenclatura y taxonomía Iniciativas globales, tanto en el ámbito geográfico como en el taxonómico: Species 2000: internet o CD ITIS: Integrated Taxonomic Information System uBio: Universal Biological Indexer and Organizer 15/42
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Información taxonómica(1)
Iniciativas internacionales Información taxonómica(1) Iniciativas restringidas en el ámbito geográfico y/o taxonómico: FAUNA EUROPAEA FLORA EUROPAEA Euro+MED Plant Base MarBef 16/42
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Información taxonómica(2)
Iniciativas internacionales Información taxonómica(2) Iniciativas restringidas en el ámbito geográfico y/o taxonómico: FAUNA IBÉRICA: base de datos IBERFAUNA FLORA IBERICA Véase también 17/42
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Redes distribuidas Iniciativas internacionales
Redes a través de las cuales se pueden consultar multitud de fuentes simultáneamente: Red Mundial de Información en Biodiversidad REMIB The Species analyst Biological Collections Access Service for Europe BioCASe 18/42
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Esquema de la charla Índice 1.- La información sobre biodiversidad.
Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. 19/42
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GBIF Esquema de la charla Índice
1.- La información sobre biodiversidad. Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. GBIF 19/42
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Iniciativa internacional de megaciencia para:
GBIF Iniciativa internacional de megaciencia para: Hacer que la información mundial sobre biodiversidad esté accesible de manera libre y universal a través de Internet Se compartan los datos científicos primarios para beneficiar a la sociedad y a la ciencia. 20/42
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GBIF Principios de GBIF: GBIF es participativa y distribuida: no existe una gran base de datos central. Los proveedores siempre mantienen el control sobre los datos. Es mundial en escala, pero se lleva a la práctica a nivel nacional y regional. Debe estar accesible desde cualquier parte del mundo, si bien será financiada por aquellos con mayor capacidad económica. 21/42
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GBIF Principios de GBIF: Promociona estándares y herramientas de software y facilita su adaptación a diferentes idiomas, juegos de caracteres y codificaciones informáticas. Toda tecnología desarrollada por GBIF debe ser de “código abierto” y distribuirse libremente. Sirve para difundir el conocimiento tecnológico aprovechando y haciendo disponible la información científica y técnica. Hace disponible los datos sobre biodiversidad de manera universal, reconociendo a su vez la contribución realizada por aquellos que compilan y comparten dichos datos. I.P.R. 22/42
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El campo de acción de GBIF
El tipo de datos que provee GBIF es único: no representa una duplicación de ninguna iniciativa existente a esta escala. Los resultados de las inversiones realizadas en otras áreas serán potenciadas con los datos y la interoperabilidad de GBIF. 23/42
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Los programas de trabajo de GBIF
DADI: Tecnología e interoperabilidad. DIGIT: Informatización de colecciones de historia natural. ECAT: Catálogo de nombres de organismos conocidos. SpeciesBanks: información a nivel de taxon. DILIB: Biblioteca digital sobre biodiversidad OCB: Divulgación y formación 24/42
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Participantes con voto – 27 Participantes asociados – 15
GBIF Miembros de GBIF: Países - 42 Participantes con voto – 27 Participantes asociados – 15 Asociaciones - 34 25/42
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Participantes con voto – 27 Participantes asociados – 15
GBIF Miembros de GBIF: Países - 42 Participantes con voto – 27 Participantes asociados – 15 Asociaciones - 34 …y socios 25/42
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La arquitectura de GBIF
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La arquitectura de GBIF
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Los portales de datos de GBIF:
Nuevo portal del Secretariado de GBIF: Portales nacionales/temáticos: Anterior prototipo del Secretariado de GBIF: 28/42
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Los portales de datos de GBIF:
Video preparado por F. Pando. 29/42
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La repatriación de datos a los países de origen
GBIF La repatriación de datos a los países de origen Puntos con alta biodiversidad Instituciones con grandes cantidades de datos sobre biodiversidad 30/42
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Derechos de propiedad intelectual
GBIF Derechos de propiedad intelectual I.P.R. Todos los usuarios deberán tener las mismas posibilidades de acceso a los datos en las bases de datos afiliadas o desarrolladas por GBIF, de una manera libre y abierta. GBIF no ha de hacer valer ningún derecho de propiedad sobre los datos afiliados a GBIF. Sí podrá hacerlo sobre las herramientas que desarrolle, si bien ha de procurar promover la transferencia no exclusiva, de toda la tecnología informática que tenga disponible a las instituciones de investigación. GBIF debe respetar las condiciones establecidas por los proveedores de datos que afilien sus bases de datos a GBIF. GBIF se esforzará en asegurar que se reconozca la fuente de los datos y solicitará que esta atribución se mantenga en cualquier uso posterior de los mismos. Nada debe privar a los propietarios de bases de datos afiliadas a GBIF en su derecho a bloquear el acceso a cualquier dato. 31/42
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Logros de GBIF hasta el momento:
El portal de acceso a datos de GBIF puede acceder a más de 136 millones de registros de 1010 bases de datos distintas. Formación: El Secretariado de GBIF organiza frecuentes sesiones de formación en colaboración con iniciativas científicas líderes. Los nodos nacionales también organizan sus propias actividades de formación. Programas de asesoramiento (mentoring) para fomentar la cooperación entre instituciones y países. Desarrollo de herramientas y tecnología para dar soporte a la estructura descentralizada de GBIF, lo que incluye la financiación de proyectos demo, seed money y campañas para fomentar y apoyar ideas innovadoras. Programa activo de repatriación de datos (Ej. ABBIF, CEPDEC, SEP). 32/42
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Esquema de la charla Índice 1.- La información sobre biodiversidad.
Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. 33/42
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GBIF España Esquema de la charla Índice
1.- La información sobre biodiversidad. Definición, fuentes, las colecciones biológicas, usos. 2.- El acceso libre a la información sobre biodiversidad. Declaraciones de organismos internacionales. 3.- Iniciativas internacionales sobre información en biodiversidad. Iniciativas globales, iniciativas regionales, redes distribuidas. 4.- La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad GBIF. Concepto y principios, campo de acción, programas de trabajo, miembros, la arquitectura de la red de GBIF, los portales de acceso a datos, repatriación de datos, derechos de propiedad intelectual y situación en el 2007. 5.- GBIF en España. Inicios, la Unidad de Coordinación de GBIF en España, servicios, el informe de colecciones de historia natural en España y su sistema de consulta, la participación española en GBIF, software, formación y capacitación. 6.- Preguntas y debate. GBIF España 33/42
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Resolución del MCYT Implantación en España GBIF España
Real Jardín Botánico Resolución del MCYT Aut. diapositiva original: F. Pando. Consejo Superior de Investigaciones Científicas Museo Nacional de Ciencias Naturales Nodo Nacional de GBIF Unidad de Coordinación 34/42
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Implantación en España
GBIF España Implantación en España febrero 2001 España firma el MoU abril 2001 plan de actuación Aut. diapositiva original: F. Pando. julio 2002 resolución del MCYT otoño 2002 sesiones informativas invierno 2002 trabajos iniciales GBIF.ES UdC, arranca julio 2003 35/42
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Servicios de GBIF España
Asesoramiento para conseguir financiación. Completo programa de formación. Software de informatización gratuito. Apoyo técnico. Asesoramiento en migraciones y recuperaciones de datos. Control de calidad. Servicio de alojamiento de datos. Portal de información sobre biodiversidad. 36/42
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NÚMERO TOTAL DE CENTROS
GBIF España El informe de colecciones Una de las primeras labores abordadas por la Unidad de Coordinación de GBIF España fue la elaboración de un informe sobre las colecciones de historia natural en España. NÚMERO TOTAL DE CENTROS Botánica 44 Zoología 33 Mixtos 18 Microbiología 3 TOTAL 98 Nº Colecciones Historia Natural Vivas TOT Zoología 91 19 110 Botánica 54 38 92 Mixtas 6 2 8 Microbiología 1 3 TOTAL 152 61 213 EJEMPL -> Nº total Inf No inf % Inf Zoología 30,52% Botánica 51,11% Mixtos 2.774 97.71% Microbiolog. 8.000 100% TOTAL 36,42 % 37/42
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El sistema de consulta GBIF España http://www.gbif.es/ic_busquedas.php
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GBIF España, en cifras (nov 2007)
DATOS PUBLICADOS: registros de citas publicados en la red. 38 instituciones publicando datos 84 bases de datos publicadas (3er puesto a nivel mundial). FINANCIACIÓN: 112 proyectos de Acciones Complementarias del MEC solicitadas. 71 proyectos aprobados. EUR movilizados. 39/42
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La participación española en GBIF
GBIF España La participación española en GBIF 40/42
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Software de informatización
GBIF España Software de informatización Para facilitar la participación de la comunidad científica española en GBIF, la Unidad de Coordinación de GBIF España tiene líneas de desarrollo de software de informatización otras herramientas afines: HERBAR y ZOORBAR: informatización y gestión de colecciones de historia natural BIBMASTER: gestión integral de información de proyectos sobre biodiversidad: bibliografía, nomenclatura y taxonomía, citas, etc. DARWIN TEST: comprobación de juegos de datos previo a su publicación en internet. 41/42
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TALLERES IMPARTIDOS DURANTE EL 2007
GBIF España Plan de formación Dos líneas bien definidas en el plan de formación de GBIF España: Replicar la formación impartida por GBIF Internacional en el contexto nacional. Mantenimiento de los talleres con más demanda, a la vez que se intentan desarrollar líneas formativas innovadoras en informática para la biodiversidad. TALLERES IMPARTIDOS DURANTE EL 2007 FECHA Herramientas y trucos informáticos para el trabajo diario 13 feb 2007 Herbar 3.4h para introductores de datos 19 feb 2007 Réplica del III taller de modelización de nichos ecológicos 14-16 mar 2007 Réplica del I taller GBIF/HerpNET de georreferenciación de bases de datos biológicas 26-28 mar 2007 Taller de iniciación a Herbar versión 3.5b 8-10 may 2007 Servidores DiGIR/TAPIR 24-25 may 2007 Calidad de datos y herramientas del GBIF 13-14 sep 2007 Herramientas informáticas para la producción de floras y faunas 12-13 nov 2007 Réplica del II taller GBIF de georreferenciación de bases de datos biológicas 28-30 nov 2007 Imágenes digitales en estudios sobre biodiversidad 12-14 dic 2007 42/42
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Y otras iniciativas internacionales
Universidad de Alicante Alicante, 14 noviembre 2007 GBIF Y otras iniciativas internacionales sobre biodiversidad Más información en: Imágenes cedidas por el Secretariado Internacional de GBIF ( y del repositorio de imágenes libres stock.xchng ( El contenido de esta presentación está sujeto a una licencia de Creative Commons, tal y como queda establecido en la página: Alberto González Talaván Unidad de Coordinación de GBIF España GBIF.ES y el Nodo Nacional de Información sobre Biodiversidad en España están patrocinado por el Ministerio Español de Educación y Ciencia, gestionado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas
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