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Manipulación de DNA Clonación Curso
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¿Cómo mantener estable un fragmento de DNA dentro de una célula?
El problema básico ¿Cómo mantener estable un fragmento de DNA dentro de una célula? Uniéndolo a un vector de clonacion
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Vector de clonacion DNA de replicación autónoma Multicopia
Dianas de restricción unicas Fenotipo seleccionable
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Diana única
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Plásmidos recombinantes
Quimeras
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Pasos en la clonación Restricción del vector y del inserto Ligación Transformación Crecimiento en placas de agar en medio selectivo
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Fragmentación de DNA Enzimas de restricción
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Werner Arber Premio Nobel de Medicina en 1978
"for the discovery of restriction enzymes and their application to problems of molecular genetics".
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dabalearrozalazorraelabad
Eje de simetría doble DIANAS de restricción Secuencias palindrómicas dabalearrozalazorraelabad ana anna
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Romos Protuberantes
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Enzimas de restricción Nº fragmentos en genoma humano
Probabilidad de corte nomenclatura Nº fragmentos en genoma humano 1/4 x 1/4x 1/4 x1/4= (1/4)4 =1/256 1/4 4 ~ 12.5x106 fragmentos (1/4)6 = 1/4096 6 ~ fragmentos (1/4)8 = 1/65536 ~ fragmentos 8
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Isosquizómeros Enzimas de restricción que reconocen la misma sequencia
Pueden cortar en el mismo sitio Como NdelI y MboI GATC O no NarI GG CGCC BbeI GGCGC C EheI GGC GCC KasI G GCGCC
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Ligación de DNA
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3´ 5´
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Animaciones> manipulación de DNA>
techniques> cutting & pasting
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Truco para favorecer la formación de recombinantes
Impedir la religación del vector
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Extremos cohesivos compatibles
¿Podríamos digerir el recombinante con BamHI?
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….NGAT ATCN….. ….NCTA TAGN….. ….NGAT ….NCTA ATCN….. TAGN….. ….NCTA ….NGAT CCTN….. GGAN….. ….NCTA ….NGAT CCTN….. GGAN…..
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Animación > Manipulation >Revolution > Players
Premio Nobel de Química 1980
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Vectores de clonacion Vectores plasmídicos
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Características de los vectores de clonación
Pequeño tamaño Marcador genético de selección Sitios únicos de restricción
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ColE1
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Vectores mejorados Mutación en las secuencias control de la replicación de ColE1 resultantes en más de 500 copias/célula Adición de múltiples sitios de clonaje únicos (MCS) (“poly-linker”)
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MCS (Multi Cloning Site)
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(polylinker)
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MCS de pUC18
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MCS de pUC19
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MCS (polylinker) en secuencia codificante para el fragmento N-terminal de la -galactosidasa.
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pUC Plac O N-lacZ pUC Plac O N-lacZ XGal IPTG
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pUC Plac O N-lacZ pUC Plac O N-lacZ XGal IPTG
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Inductor IPTG Allolactosa Isopropil b D tiogalctósido INDUCTOR
no hidrolizable
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Ensayo de b-galactosidasa
X-gal
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MCS (polylinker) en secuencia codificante para el fragmento N-terminal de la -galactosidasa.
Selección de plásmidos con inserto: colonias blancas en placas con IPTG y X-Gal.
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+ X-gal + X-gal Colonias blancas Colonias azules
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Animación> clonación / clonación (vectores plasmídicos)
+ IPTG Animación> clonación / clonación (vectores plasmídicos)
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+ inserto - inserto
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Vectores lanzadera Shuttle
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