Aplicaciones comerciales de la bioinfomática Agrobiotecnología Farmaceutica Investigación básica biotecnología industrial
M.A.S (Selección Asistida por marcadores). ➲ Técnica utilizada actualmente para la mayoría de los traits. ➲ Seguimiento de los traits usando marcadores moleculares ➲ Conceptos involucrados: Selección “tradicional”. Marcadores moleculares
Selección tradicional ➲ Se determina una propiedad (trait) que se desea modificar (altura, % de aceite, color de hoja resistencia a quiebre, a enfermedades, etc). ➲ Se identifica fuente del trait (o se induce si no la hubiese). ➲ Se cruza la variedad que tiene el trait de interes, contra línea elite. ➲ Se busca en la descendencia a los portadores del trait. ➲ Se cruza nuevamente con los progenitores
Marcadores moleculares ➲ Permiten “mapear” zonas específicas del cromosoma. ➲ Tienen sentido ubicarlos en regiones de alta variabilidad nucleotídica: Regiones no codificantes (NCR, aka “junk DNA”). Intrones Secuencias repetitivas.
MAS ➲ Se determina una propiedad (trait) que se desea modificar (altura, % de aceite, color de hoja resistencia a quiebre, a enfermedades, etc). ➲ Se identifica fuente del trait (o se induce si no la hubiese). ➲ Se cruza la variedad que tiene el trait de interes, contra línea elite. ➲ Se busca en la descendencia a los portadores de los marcadores. ➲ Se cruza nuevamente con los progenitores
Ventajas uso de MAS ➲ Aceleración de tiempos. ➲ Ahorro al no continuar lineas sin el trait.
Aportes de la Bioinformática al MAS ➲ Construcción de bases de datos de marcadores moleculares ➲ ID de NCR ➲ Diseño de primers ➲ Búsqueda regiones polimorficas ➲ ID de SNPs
Búsqueda de intrones