INTERACCIÓN GENOTIPO - AMBIENTE Juan Burgueño Septiembre 2013
Interacción genotipo x ambiente Fenotipo = Genotipo + Ambiente + Interacción
Diferentes tipos de interacción
Modelo de análisis
de regresión en genotipos (GREG) de regresión en sitios (SREG)
6 países 31 sitios 2 años 33 ambientes 10 genotipos EJEMPLO 6 países 31 sitios 2 años 33 ambientes 10 genotipos
Años y localidades usadas: 2009 País Localidad Colombia La Catalina El Salvador Armenia Los Horcones San Cristobal Santa Cruz Porrillo Guatemala Cuyuta1 Cuyuta2 Nueva Concepcion Honduras Las Acacias Playita Mexico Agua Fria Agua FriaLowN Cotaxtla TLDrought TLHighDensity Nicaragua El Plantel/Managua 2010 País Localidad Guatemala Jalapa La Maquina Monjas1 Monjas2 Polochic Quesada Sonarate Honduras Agua Blanca Choluteca La Ceiba Sulaco Yoro Mexico Agua Fria Cotaxtla Nicaragua Juigalpa Masatepe Santa Rosa/Managua
Componentes de varianza Fuente de Variación Varianza Genotipo 0.1216 Año-Genotipo 0.0175 Localidad-Genotipo 0.1262 Año-Localidad-Genotipo 0.1759 Bloque 0.0764 Residual 0.6077 1.1252
Modelo de análisis regresión en sitios (SREG)
9CC 2009 Colombia La 0GM 2010 Guatemala La Máquina 9EA El Salvador Armenia 0GM1 Monjas1 9EH Los Horcones 0GM2 Monjas2 9EC San Cristóbal 0GP Polochic 9EP Santa Cruz Portillo 0GQ Quesada 9GC1 Cuyuta1 0GS Sonarate 9GC2 Cuyuta2 0HA Honduras Agua Blanca 9GN Nueva Concepción 0HC Choluteca 9HA Las Acacias 0HL La Ceiba 9HP Playita 0HS Sulaco 9MA Mexico Agua Fría 0HY Yoro 9MLN Agua LN 0MA 9MC Cotaxtla 0MC 9MTD TLDrought 0NJ Nicaragua Juigalpa 9MTH TLHighDensity 0NM Masatepe 9NP El Plantel 0NS Santa rosa 0GJ Jalapa
Otro Ejemplo 9 genotipos en 20 ambientes
Cluster de genotipos 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 Height
Cluster de ambientes
- 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0 Factor 1 Factor 2 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 G8 G9
Significant non-COI due to HV Subsets Total tetrads Significant tetrads Significant COI Significant non-COI due to HV n % ---------------------------------------------------------- Within subsets of environments ---------------------------------- (1,3,10) 108 --- (4,5,9,15,16,17,20) 756 65 8.6 100 (11,12,13,18) 216 16 7.41 (2,6,7,14,19) 360 ---------------------------------------------------------- Among subsets of environments --------------------------------- (1,3,10)(4,5,9,15,16,17,20) 13 17.86 19 14 116 86 (1,3,10)(11,12,13,18) 432 54 12.5 21 39 33 61 (1,3,10)(2,6,7,14,19) 540 25 4.63 11 44 56 (1,3,10)(8) 2 1.85 (4,5,9,15,16,17,20)(11,12,13,18) 1008 51 5.06 (4,5,9,15,16,17,20)(2,6,7,14,19) 1260 3.1 (4,5,9,15,16,17,20)(8) 252 24.21 12 20 49 80 (11,12,13,18)(2,6,7,14,19) 720 58 8.06 (11,12,13,18)(8) 144 27.08 4 10 35 90 (2,6,7,14,19)(8) 180 22 12.22 3 Total 6840 57 8.29 70 12.3 497 87.7
Significant non-COI due to HV Subsets Total tetrads Significant tetrads Significant COI Significant non-COI due to HV n % ---------------------------------------------------------- Within subsets of environments ---------------------------------- (1,3,10) 108 --- (4,5,9,15,16,17,20) 756 65 8.6 100 (11,12,13,18) 216 16 7.41 (2,6,7,14,19) 360 ---------------------------------------------------------- Among subsets of environments --------------------------------- (1,3,10)(4,5,9,15,16,17,20) 13 17.86 19 14 116 86 (1,3,10)(11,12,13,18) 432 54 12.5 21 39 33 61 (1,3,10)(2,6,7,14,19) 540 25 4.63 11 44 56 (1,3,10)(8) 2 1.85 (4,5,9,15,16,17,20)(11,12,13,18) 1008 51 5.06 (4,5,9,15,16,17,20)(2,6,7,14,19) 1260 3.1 (4,5,9,15,16,17,20)(8) 252 24.21 12 20 49 80 (11,12,13,18)(2,6,7,14,19) 720 58 8.06 (11,12,13,18)(8) 144 27.08 4 10 35 90 (2,6,7,14,19)(8) 180 22 12.22 3 Total 6840 57 8.29 70 12.3 497 87.7
Significant non-COI due to HV Environments Genotypes Total tetradas Significant tetrads Significant COI Significant non-COI due to HV n % (1,3,10) (G1,G2,G3,G7) 18 --- (G4,G5,G6,G9) (11,12,13,18) 36 (2,6,7,14,19) 60 (4,5,9,15,16,17,2) 126 480 (G1,G2,G3,G7)(G4,G5,G6,G9) 48 (G1,G2,G3,G7)(G8) 12 (G4,G5,G6,G9)(G8) 96 11 100 24 1 4 17 160 40 336 35 10 84 8 22 26
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