Filogenia. Filogenia Filogenia y genealogía La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón.

Presentación del tema: "Filogenia. Filogenia Filogenia y genealogía La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón."— Transcripción de la presentación:

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2 Filogenia

3 Filogenia y genealogía

4 La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón

5 Un árbol evolutivo es una hipótesis

6 Filogenia basada en la morfología

7 Filogenética

8 Árbol basado en caracteres morfológicos

9 Datos moleculares vs. datos morfológicos

10 Análisis filogenético

11 Un árbol filogenético es un gráfico bidimensional que muestra relaciones evolutivas entre organismos o, en el caso de secuencias, entre determinados genes de diversos organismos. Gene tree Species tree Árbol filogenético

12 ¿Para qué se puede utilizar la filogenética?

13 The tree of life vs. the web of life

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15 Terminología (1)

16 Terminología (2)

17 Nodos terminales (hojas) Estructura de un árbol filogenético (1)
Los nodos terminales (hojas) representan a los distintos taxa. Todos ellos son contemporáneos Cada una de las unidades filogenéticas representadas en el árbol es un taxón (plural taxa) raíz La raíz representa al “último ancestro común” del que derivan todos los taxa representados en el árbol Nodos terminales (hojas) Estructura de un árbol filogenético (1)

18 Estructura de un árbol filogenético (2)
Las relaciones entre los distintos taxa se indican mediante nodos y ramas Cada nodo es una bifurcación de la ruta evolutiva que da lugar a dos especies distintas. De cada nodo surgen dos ramas (árbol binario), que evolucionarán de forma distinta. Nodos internos La longitud de cada rama representa el número de cambios producidos antes de llegar a la siguiente bifurcación ramas Estructura de un árbol filogenético (2)

19 Estructura de un árbol filogenético (3)

20 Ancestro común del clado El grupo externo y los clados
Clado (equinodermos) Grupo externo Ancestro común del clado raíz El grupo externo y los clados

21 Un clado es un conjunto de especies emparentadas (que comparten un antepasado común). Su representación gráfica se denomina cladograma. Varios clados se pueden agrupar en un clado de orden superior Clados y cladogramas

22 Un cladograma se puede representar de muchas maneras
Un cladograma se puede representar de muchas maneras. Lo único que importa es el orden en el que se suceden las diversas bifurcaciones, es decir, su topología. Todos los cladogramas de esta figura son equivalentes. Topología del árbol

23 La forma del árbol y las bifurcaciones que contempla constituyen su “topología”.
Estos cuatro árboles son equivalentes. Se puede rotar cualquier nodo interno sin que cambie la topología porque esta operación no cambia el agrupamiento de las especies. Topología del árbol (2)

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25 La flecha del tiempo

26 Cladogramas y filogramas

27 Cladogramas y filogramas
En un cladograma, la longitud de las ramas no contiene ningún tipo de información. Sólo indican en qué orden se sucedieron las ramificaciones. En un filograma, la longitud de las ramas es proporcional a la divergencia. Suelen incluir una escala que indica los cambios acumulados con el tiempo. Cladogramas y filogramas

28 Con moléculas: la hipótesis del reloj molecular

29 El citocromo c es un reloj molecular

30 Inconvenientes de la hipótesis del reloj molecular

31 El registro fósil es el mejor reloj evolutivo

32 Filogenia con escala temporal

33 El registro fósil ayuda a construir o modificar árboles filogenéticos

34 Tipos de árbol

35 Árboles con raíz y sin raíz

36 5 nodos terminales (OTU) Anatomía de los árboles filogenéticos
Nodos internos (n-2) internas 2n-2 2n-3 (n-3) internas Ramas n externas n externas Anatomía de los árboles filogenéticos

37 Un árbol evolutivo con raíz muestra las relaciones evolutivas que hay entre secuencias que proceden de un mismo ancestro y el orden cronológico en que tuvieron lugar las diversas ramificaciones. También puede mostrar qué especies presentan una velocidad evolutiva elevada. Árboles con raíz

38 Un árbol evolutivo sin raíz también muestra las relaciones evolutivas que hay entre las diversas secuencias pero no especifica la ubicación del último ancestro común ni el orden temporal en que tuvieron lugar las diversas ramificaciones. La longitud de cada rama es proporcional a la distancia evolutiva. Árboles sin raíz

39 Árboles escalados y sin escalar (1)

40 Árboles escalados y sin escalar (2)

41 Posibles combinaciones

42 Bosques filogenéticos (1)

43 Bosques filogenéticos (2)

44 Árbol verdadero y árboles inferidos

45 El formato Newick