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CLUSTALW2.

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Presentación del tema: "CLUSTALW2."— Transcripción de la presentación:

1 CLUSTALW2

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3 CLUSTALW2 Para hacer un AMS con ClustalW2: 0.- Seleccionar las secuencias en formato FASTA 1.- Introducir las secuencias en el campo 2.- Seleccionar los parámetros del alineamiento por parejas 3.- Seleccionar los parámetros del alineamiento múltiple 4.- Indicar si quieres recibir los resultados por Cómo se hace un AMS con ClustalW2 5.- Go!!

4 CLUSTALW2 1.- Introducir las secuencias Pueden ser secuencias de DNA o de proteínas Corta/pega las secuencias aquí (de una en una). El límite son 500. Si ya tienes las secuencias seleccionadas en un único archivo, pincha aquí para cargarlo en el formulario. El tamaño máximo del archivo es 1 Mega

5 CLUSTALW2 2.- Selecciona parámetros del alineamiento por parejas Selecciona la matriz de sustitución Selecciona la penalización por abrir un indel Selecciona la penalización por extender un indel

6 CLUSTALW2 3.- Selecciona parámetros del alineamiento múltiple

7 CLUSTALW2 4.- Indica si quieres los resultados por Indica si quieres recibir el resultado por e- mail Go!!

8 CLUSTALW2 Se está realizando el alineamiento

9 CLUSTALW2 El alineamiento múltiple de secuencias Puedes guardar el AMS para usarlo con otros programas Puedes aplicar colores al AMS

10 CLUSTALW2 Se pueden aplicar colores al alineamiento

11 CLUSTALW2 Otros resultados

12 CLUSTALW2 Resumen del alineamiento Puedes utilizar JalView para ver o editar el AMS Resultado de los alineamientos por parejas

13 CLUSTALW2 JalView

14 CLUSTALW2 Árbol guía generado por ClustalW2 para hacer el AMS Con el botón derecho del ratón se activa un menú que permite cambiar el aspecto del árbol guía.

15 CLUSTALW2 Detalles del alineamiento Pincha aquí para hacer un nuevo AMS


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