UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Claves y Secretos de una Tesis exitosa en Analytics La.

Presentación del tema: "UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Claves y Secretos de una Tesis exitosa en Analytics La."— Transcripción de la presentación:

1 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Claves y Secretos de una Tesis exitosa en Analytics La experiencia del Primer Tesista de la Maestría en DM & KD de la UBA Armando Taié Licenciado en Sistema Universidad Nacional del Nordeste Magister en Explotación de Datos y Descubrimiento del Conocimiento Universidad de Buenos Aires

2 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Tema: Desarrollo de una metodología de extracción de conocimientos a partir de micromatrices de DNA basada en ontologías genéticas

3 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Nivel de expresión de un gen

4 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Micromatrices

5 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Datos y Tablas 57.381 expresiones genéticas por muestras National Center for Biotechnology Information 3 experimentos con 47 muestras (11+24+12) Datos procesados 57.381 * 47 = 2.696.907 Tablas generadas: exper, sample y affychip Base de Datos de la Gene Ontology Consortium de términos GO

6 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Tema de Tesis Cómo lo elegí al tema – Taller de Tesis – Exposición del Dr. Marcelo Soria (Bioinformática) – Dra. Paula Fernandez y Dra. Marisa Farber - Centro Investigación Ciencias Veterinarias y Agronómicas - CICVyA INTA Castelar

7 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Tema de Tesis Porque me atrajo – Interés tanto personal como para el INTA – Desafío relevante a gran escala – Desarrollo personal y profesional

8 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Investigación previa

9 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Investigación y preparación previa Vocabulario Conocimiento de Contexto – “ABC” de la Biología Molecular – Micromatrices – Ontologías Genéticas Papers científicos Entre 4 y 6 meses (de los dos años total) Comenzar a delinear el tema Escribir la presentación de la tesis Primera etapa finaliza con la presentación de la tesis a las autoridades de la maestría – De las Hipótesis a los Datos vs. de los Datos a las Hipótesis

10 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Director y Codirectores

11 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Directores y Codirectores Directora: Dra. Ana Haedo Vice Directora y Profesora de la Maestría en DM & KD - FCEyN – UBA Co-directora: Dra. Norma Paniego Investigadora del Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas INTA Castelar Coordinadora del Proyecto de Bioinformática de INTA Co-director: Dr. Marcelo Soria Investigador y Profesor de FAUBA

12 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Directores y Codirectores Cómo los elegí. Porque los elegí – Profundo conocimiento en la metodología científica, teórica y técnica – Conocimiento de contexto y visión del estado de la ciencia – Interacción entre las dos áreas del conocimiento Que me brindaron y enseñaron – Excelencia profesional – Trabajar científicamente – Lectura de papers… – Apoyo científico y humano – Calidad y calidez de la persona

13 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Sugerencias en la búsqueda del Director de Tesis Interés en el desarrollo de la tesis Excelencia en el conocimiento – DM & KD – Área de aplicación Tiempo y dedicación Calidad de persona Disciplina científica y metodológica

14 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Material de Investigación

15 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Material de Investigación Búsqueda personal y sugerencia de mis directores Fuentes – Papers – Libros – Sitios Web – Documentos de fabricantes de micromatrices – Documentos de soft MySQL y R – Documentación de NCBI y GO – Y muchos, pero muchos papers

16 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Desarrollo y Redacción de Tesis

17 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Desarrollo de la tesis Duración: Un año – 3 meses finales full time Datos micromatrices (NCBI) – Descarga de BD – Comprensión – Adaptación Desarrollo de procesos y obtención de resultados – MySQL y R – BD GO

18 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Redacción de la tesis Escritura en paralelo al desarrollo Llevar bitácora de lo que vas haciendo y leyendo – Anotar todo ! – Sirve de base para la redacción final El primer borrador de cada una de las partes vuelve todo corregido (No se asusten… es normal) Las distintas secciones van y vuelven desde los borradores pasando por las distintas versiones de corrección. Cuando se termina de escribir todo, lectura general para uniformar. Cuidar uniformidad y completitud de apartados.

19 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Trámites Finales y Desarrollo de la Presentación

20 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Trámites Finales Una vez finalizada, presentar a las autoridades de la maestría la versión final de la tesis. Búsqueda del Jurado y aceptación Envío de tesis para su lectura Coordinar día de defensa Trámites administrativos Duración: Los últimos seis meses

21 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Desarrollo de la presentación Mostrar en una presentación de 40 minutos todo el trabajo Énfasis en Resultado, Discusión y Conclusiones Muchos ensayos ! Preparación del aula de la defensa

22 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Defensa

23 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Defensa Y llegó el día tan esperado ! Es una verdadera DEFENSA. Defender la posición de porqué se hizo lo que se hizo Es una Experiencia única. 40 minutos exposición y 40 minutos de preguntas. Conocimiento y técnica de exposición

24 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Qué hacer y qué evitar.

25 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Algunos items … Trabajo personal – A pesar del gran apoyo de mis directores Etapas – Peligro inter-etapas Tiempo de realización – 2 años part time – 1 año full time Apoyo del entorno y sobre todo de la familia

26 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Qué hacer Tener el objetivo claro, en mi caso UN IDEAL. Dedicar sistemáticamente un tiempo diario a la tesis Cuidarse de los estancamientos (inter-etapas)

27 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Que no hacer Viajar tanto ! Dejar de preguntar a tus directores Áreas del conocimiento no cubierta por los directores.

28 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Futuro

29 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Futuro Institucionalizar el DM & KD en el INTA Proyecto de Descubrimiento de Conocimiento a partir de datos de Micromatrices con Ontologías Proyecto de Predicción de Caudales de Ríos y Lluvias Paralelización de procesos – Grid Computing Comunicación de las ventajas de estas técnicas Enorme cantidad aplicaciones dentro de INTA Necesidad de mas RRHH especializado en DM & KD Futuro altamente promisorio

30 UBA-FCEyN FIUBA-FAUBA INTA EEA Corrientes CICVyA – INTA Castelar Profesionales Analytics Cono Sur Agradecimientos